RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLVS1-205	ENST00000519846	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	NEK1	Q96PY6	1258 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	BTBD7	Q9P203	1132 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	SRRD	Q9UH36	339 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	SORBS3	O60504	671 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	CYP2C19	P33261	490 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	MAP3K10	Q02779	954 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	C17orf99	Q6UX52	265 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	MMP19	Q99542	508 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	RNF146	Q9NTX7	359 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	MYH1	P12882	1939 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLVS1-205	ENST00000519846	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	CPLX1	O14810	134 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	ATP9B	O43861	1147 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	ORC4	O43929	436 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	CFB	P00751	764 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	FCER1A	P12319	257 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	MTFR1	Q15390	333 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	BRF1	Q92994	677 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	DEFB118	Q96PH6	123 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	SENP2	Q9HC62	589 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	KLRF2	D3W0D1	207 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	POTEB2	H3BUK9	544 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	CCL14	Q16627	93 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	GPR142	Q7Z601	462 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	MAPK4	P31152	587 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	APOBR	Q0VD83	1088 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	STK32A	Q8WU08	396 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	MAP4K1	Q92918	833 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	FEM1B	Q9UK73	627 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	INHA	P05111	366 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	BCR	P11274	1271 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	ADORA2A	P29274	412 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	RGS2	P41220	211 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	TRIM32	Q13049	653 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	MOGS	Q13724	837 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	TMC2	Q8TDI7	906 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	UIMC1	Q96RL1	719 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	NBPF3	Q9H094	633 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	VWA5A	O00534	786 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	PSMA5	P28066	241 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	SP4	Q02446	784 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	KRT32	Q14532	448 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM160B2	Q86V87	743 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	DPF3	Q92784	378 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	CTGF	P29279	349 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLVS1-205	ENST00000519846	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49

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