RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404548.5

HDAC11-205, Transcript of histone deacetylase 11, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HDAC11, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11-205ENST00000404548 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.95■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 ASTN1O14525 1302 aa22.94■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.94■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 ICAM1P05362 532 aa22.94■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 ALAS1P13196 640 aa22.94■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.94■■□□□ 1.26
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HDAC11-205ENST00000404548 RASIP1Q5U651 963 aa22.94■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 MORC4Q8TE76 937 aa22.94■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 Q9Y3F1 56 aa22.94■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 NMT2O60551 498 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 CD4P01730 458 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 DNAJB2P25686 324 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 TLK2Q86UE8 772 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 TMEM199Q8N511 208 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 MYLIPQ8WY64 445 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.261e-7■■■□□ 15.1
HDAC11-205ENST00000404548 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 TTC28Q96AY4 2481 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 FOSL2P15408 326 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 VPS53Q5VIR6 699 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 VTA1Q9NP79 307 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 MUC3AQ02505 3323 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 ZEB2O60315 1214 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 PDE1AP54750 535 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 TMEM240Q5SV17 173 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 INCENPQ9NQS7 918 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 PNMA2Q9UL42 364 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 CSF2RAP15509 400 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 SMPD1P17405 629 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 BEX3Q00994 111 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC11-205ENST00000404548 FGAP02671 866 aa22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 CCDC96Q2M329 555 aa22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 TIFAQ96CG3 184 aa22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 NT5C2P49902 561 aa22.88■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 ITGA7Q13683 1181 aa22.88■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.88■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 NSMFQ6X4W1 530 aa22.88■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 ZNF576Q9H609 170 aa22.88■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 LCTP09848 1927 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 SNAP25P60880 206 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 GRIN2CQ14957 1233 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 FAM227BQ96M60 508 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 IL23AQ9NPF7 189 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 GRIN2DO15399 1336 aa22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 A0A0D9SFI3 127 aa22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 AAMPQ13685 434 aa22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 HERVK_113Q902F9 699 aa22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 TTC14Q96N46 770 aa22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 HIPK3Q9H422 1215 aa22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 SNHG28P0DPA3 235 aa22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 PDHBP11177 359 aa22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 ZNF365Q70YC5 407 aa22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 PBX4Q9BYU1 374 aa22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 TOMM22Q9NS69 142 aa22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 CYP2C18P33260 490 aa22.84■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 SLC16A2P36021 539 aa22.84■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.84■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.84■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HDAC11-205ENST00000404548 MAF1Q9H063 256 aa22.84■■□□□ 1.25
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