RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZSWIM9Q86XI8 627 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 HOMER1Q86YM7 354 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 LINC00116Q8NCU8 138 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 APPBP2Q92624 585 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 OSBP2Q969R2 916 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 C1orf159Q96HA4 380 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 TOX2Q96NM4 488 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 FANCLQ9NW38 375 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 DUSP13Q9UII6 198 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 BACE2Q9Y5Z0 518 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 STXBP3O00186 592 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 MEIS1O00470 390 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 AURKAO14965 403 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 ESR1P03372 595 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRT1P04264 644 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 CD3EP07766 207 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 IFNGR1P15260 489 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 LTKP29376 864 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 TEKQ02763 1124 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 CYP4F3Q08477 520 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 TESK1Q15569 626 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 RTP2Q5QGT7 225 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 FOXB2Q5VYV0 432 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 RCSD1Q6JBY9 416 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 AMIGO3Q86WK7 504 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 ASB11Q8WXH4 323 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 MCMBPQ9BTE3 642 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 IER2Q9BTL4 223 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC12A9Q9BXP2 914 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZSWIM5Q9P217 1185 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 NCANO14594 1321 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRRC10BA6NIK2 292 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 WASH4PA8MWX3 477 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 SYPP08247 313 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 CD96P40200 585 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 GRIA2P42262 883 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 RAP1GAPP47736 663 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 POU4F1Q01851 419 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 AOC3Q16853 763 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 LILRA6Q6PI73 481 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 NPLOC4Q8TAT6 608 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 UBE2FQ969M7 185 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPP1R16BQ96T49 567 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 FEZ1Q99689 392 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 FOXP3Q9BZS1 431 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 TCFL5Q9UL49 500 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 CADPSQ9ULU8 1353 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM82A0PJX8 343 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRRG2O14669 202 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRODHO43272 600 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 VAV1P15498 845 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 HOXC12P31275 282 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 EGR3Q06889 387 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 SCRN1Q12765 414 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 TKFCQ3LXA3 575 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 TTLL10Q6ZVT0 673 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 CREG2Q8IUH2 290 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM145Q8NBT3 493 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 COPS5Q92905 334 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCDC140Q96MF4 163 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDC6Q99741 560 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 CYP26B1Q9NR63 512 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 DLX3O60479 287 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 CPP00450 1065 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 THBDP07204 575 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCNAB2Q13303 367 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 IKZF1Q13422 519 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 TCEA2Q15560 299 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 NTRK3Q16288 839 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-190P-201ENST00000384154 DPY19L1Q2PZI1 675 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms