RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 ABCC3O15438 1527 aa22.61■■□□□ 1.21
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NCKAP1-201ENST00000360982 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1-201ENST00000360982 CCDC6Q16204 474 aa22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1-201ENST00000360982 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.61■■□□□ 1.21
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NCKAP1-201ENST00000360982 GDF11O95390 407 aa22.59■■□□□ 1.21
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NCKAP1-201ENST00000360982 PEX26Q7Z412 305 aa22.59■■□□□ 1.21
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NCKAP1-201ENST00000360982 CYP4A11Q02928 519 aa22.58■■□□□ 1.21
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NCKAP1-201ENST00000360982 ODR4Q5SWX8 454 aa22.58■■□□□ 1.21
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NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.58■■□□□ 1.21
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NCKAP1-201ENST00000360982 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.58■■□□□ 1.21
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NCKAP1-201ENST00000360982 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.58■■□□□ 1.21
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NCKAP1-201ENST00000360982 C21orf2O43822 256 aa22.57■■□□□ 1.2
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NCKAP1-201ENST00000360982 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.57■■□□□ 1.2
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NCKAP1-201ENST00000360982 CYP21A2P08686 494 aa22.57■■□□□ 1.2
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NCKAP1-201ENST00000360982 GABPAQ06546 454 aa22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 GEN1Q17RS7 908 aa22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.57■■□□□ 1.2
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NCKAP1-201ENST00000360982 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.56■■□□□ 1.2
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NCKAP1-201ENST00000360982 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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NCKAP1-201ENST00000360982 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 PSMC4P43686 418 aa22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 KCTD1Q719H9 257 aa22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 IFT20Q8IY31 132 aa22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 GAP43P17677 238 aa22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 KIF11P52732 1056 aa22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 LCORLQ8N3X6 602 aa22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1-201ENST00000360982 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.55■■□□□ 1.2
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