RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 USP17L11C9JVI0 530 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 USP17L18D6R9N7 530 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 USP17L22D6RA61 530 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 USP17L19D6RCP7 530 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 USP17L20D6RJB6 530 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 WNT10BO00744 389 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 ATP1A3P13637 1013 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 NOVP48745 357 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 USP17L24Q0WX57 530 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 MTFR1LQ9H019 292 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 ANO10Q9NW15 660 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 PSEN1P49768 467 aa20.24■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 SLFN13Q68D06 897 aa20.24■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 TBCKQ8TEA7 893 aa20.24■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.24■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.24■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 F5H6K3 240 aa20.24■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.24■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 KLRC3Q07444 240 aa20.24■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 PTGS1P23219 599 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 TMX1Q9H3N1 280 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 CALML3P27482 149 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 JDP2Q8WYK2 163 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 CNTNAP1P78357 1384 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 SNHG28P0DPA3 235 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 TNNI2P48788 182 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 LRMPQ12912 555 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 SOGA3Q5TF21 947 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 LRRC15Q8TF66 581 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 POSTNQ15063 836 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF592Q92610 1267 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 EDIL3O43854 480 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 TDP2O95551 362 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 NDUFB10O96000 172 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 EHD4Q9H223 541 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM232C9JQI7 657 aa20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 POTEDQ86YR6 584 aa20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 MTRQ99707 1265 aa20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 MRIQ9BWK5 157 aa20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.21■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 MYH4Q9Y623 1939 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF75DP51815 510 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 STX17P56962 302 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 NLRP12P59046 1061 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 SLC37A4O43826 429 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 TECP42680 631 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 C6orf50Q9HD87 102 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 PTGER2P43116 358 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 TGFB2P61812 414 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 PAGE5Q96GU1 130 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms