RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa18.28■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.28■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 STX10O60499 249 aa18.28■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 CDAN1Q8IWY9 1227 aa18.28■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 MTUS1Q9ULD2 1270 aa18.28■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 IVLP07476 585 aa18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 BCRP11274 1271 aa18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 TTLL6Q8N841 843 aa18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 CYP2D6P10635 497 aa18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 KRT5P13647 590 aa18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 RRAGAQ7L523 313 aa18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.27■□□□□ 0.52
ITGA3-202ENST00000320031 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 LRMPQ12912 555 aa18.27■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.27■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 SLC39A2Q9NP94 309 aa18.27■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 HARSP12081 509 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 CARD6Q9BX69 1037 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 MEGF6O75095 1541 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 GDF11O95390 407 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 STOX1Q6ZVD7 989 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 GPATCH11Q8N954 259 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 ORC4O43929 436 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 SLC16A2P36021 539 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 TXNRD1Q16881 649 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 SPICE1Q8N0Z3 855 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 TSKSQ9UJT2 592 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 MAN1B1Q9UKM7 699 aa18.26■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM179Q6ZVK1 233 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 COA7Q96BR5 231 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 RASSF4Q9H2L5 321 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 KIAA1024Q9UPX6 916 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 PTPREP23469 700 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 COPB1P53618 953 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 USP14P54578 494 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 SEL1L2Q5TEA6 688 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 RAD17O75943 681 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 NTSR2O95665 410 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 ERCC3P19447 782 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 GIMAP7Q8NHV1 300 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM47Q9BQJ4 181 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 INCENPQ9NQS7 918 aa18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 SYDE2Q5VT97 1194 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 RESP18Q5W5W9 173 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 FAM178BQ8IXR5 827 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 SP8Q8IXZ3 490 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC77Q9BR77 488 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 MYO3BQ8WXR4 1341 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 KIF4AO95239 1232 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 CRKP46108 304 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 STAT2P52630 851 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC26Q8TAB7 109 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 MYOM1P52179 1685 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 VGLL3A8MV65 326 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC50Q8IVM0 306 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 NLRC4Q9NPP4 1024 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 LONRF3Q496Y0 759 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 HDXQ7Z353 690 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa18.24■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 GJC1P36383 396 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 GPSM2P81274 684 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 H0YCG3 227 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 TRPC3Q13507 836 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 ELF2Q15723 593 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 LRCH2Q5VUJ6 765 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 TYW1BQ6NUM6 668 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 C10orf67Q8IYJ2 551 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 WDR11Q9BZH6 1224 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 ATP2A1O14983 1001 aa18.23■□□□□ 0.51
ITGA3-202ENST00000320031 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms