RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-222ENST00000635152 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 USP17L5A8MUK1 530 aa14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 TPM1P09493 284 aa14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 RHBDL3P58872 404 aa14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 GTF2IP78347 998 aa14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 UBXN1Q04323 297 aa14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 TXNRD1Q16881 649 aa14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 CNGA4Q8IV77 575 aa14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 TADA3O75528 432 aa14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 ATP2B4P23634 1241 aa14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 TECP42680 631 aa14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 KIFC2Q96AC6 838 aa14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 ABL1P00519 1130 aa14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 PLCG1P19174 1290 aa14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 TEX35Q5T0J7 233 aa14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.74□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 IL1R1P14778 569 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 MAP3K9P80192 1104 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 SOGA3Q5TF21 947 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 ADSSL1Q8N142 457 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 TRIM47Q96LD4 638 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 TMEM260Q9NX78 707 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 SNED1Q8TER0 1413 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 KRT9P35527 623 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 ERVK-24P63145 666 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 SPAG1Q07617 926 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 CRY2Q49AN0 593 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 GALNT17Q6IS24 598 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 CABP7Q86V35 215 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 TBCKQ8TEA7 893 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 C6orf50Q9HD87 102 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 OR52Z1P0C646 297 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 KRT222Q8N1A0 295 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 COA7Q96BR5 231 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 ST7Q9NRC1 585 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 KLRC4O43908 158 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 MXD3Q9BW11 206 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 KIF5CO60282 957 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 PLCG2P16885 1265 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 GNA11P29992 359 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 TXKP42681 527 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 NEK8Q86SG6 692 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 POTEDQ86YR6 584 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 HPS3Q969F9 1004 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 H7C1D1 291 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 SLURP2P0DP57 97 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 DMTNQ08495 405 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 CERKQ8TCT0 537 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.71□□□□□ -0.05
BRF1-222ENST00000635152 PSMA7O14818 248 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 ASIC1P78348 528 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 DDR1Q08345 913 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 PDE4DQ08499 809 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 STIM1Q13586 685 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 CHP1Q99653 195 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 BBOX1O75936 387 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 FCER1AP12319 257 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 ATP2B2Q01814 1243 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 SBF2Q86WG5 1849 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 TTC26A0AVF1 554 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.4 ms