RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
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PTPRJ-208ENST00000615445 USP17L3A6NCW0 530 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 USP17L4A6NCW7 530 aa22.89■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 MAP3K9P80192 1104 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.89■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.88■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 XKR9Q5GH70 373 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 PGBD1Q96JS3 809 aa22.88■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.88■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 FAM170AA1A519 330 aa22.87■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 RAD17O75943 681 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 PEX26Q7Z412 305 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.85■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 STAMBPO95630 424 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 LAMC1P11047 1609 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 K7ENM7 598 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 NPR1P16066 1061 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 COA1Q9GZY4 146 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.84■■□□□ 1.25
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