RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 NAPAP54920 295 aa16.97■□□□□ 0.31
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CTIF-205ENST00000587860 PIGSQ96S52 555 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-205ENST00000587860 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-205ENST00000587860 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
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CTIF-205ENST00000587860 MSL1Q68DK7 614 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-205ENST00000587860 IQUBQ8NA54 791 aa16.97■□□□□ 0.31
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CTIF-205ENST00000587860 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
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CTIF-205ENST00000587860 SLC16A2P36021 539 aa16.96■□□□□ 0.31
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CTIF-205ENST00000587860 MTA3Q9BTC8 594 aa16.96■□□□□ 0.31
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CTIF-205ENST00000587860 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
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CTIF-205ENST00000587860 DTHD1Q6ZMT9 781 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
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CTIF-205ENST00000587860 A0A1B0GUL6 1792 aa16.93■□□□□ 0.3
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CTIF-205ENST00000587860 PACS2Q86VP3 889 aa16.92■□□□□ 0.3
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CTIF-205ENST00000587860 TXLNBQ8N3L3 684 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 DEF6Q9H4E7 631 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 TRIM10Q9UDY6 481 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 SCN7AQ01118 1682 aa16.92■□□□□ 0.3
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