RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 PNMA2Q9UL42 364 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 PEX10O60683 326 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 CNMDO75829 334 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMARCA1P28370 1054 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 COPB2P35606 906 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 PIBF1Q8WXW3 757 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCPG1Q9ULG6 757 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 CEP350Q5VT06 3117 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 NID2Q14112 1375 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC25A27O95847 323 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ICAM1P05362 532 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 CDC27P30260 824 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 MCM2P49736 904 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 FCGRTP55899 365 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRAF1Q13077 416 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 Q3C1V9 767 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 REPS2Q8NFH8 660 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 PIGSQ96S52 555 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 RIOX1Q9H6W3 641 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 MYH6P13533 1939 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ATP2A1O14983 1001 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZBTB5O15062 677 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 PFKFB2O60825 505 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 CDKL5O76039 1030 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ALAS1P13196 640 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 MAPK4P31152 587 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 LBX1P52954 281 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ME3Q16798 604 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 POTEEQ6S8J3 1075 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 NBPF11Q86T75 865 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 FBXO11Q86XK2 927 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 MROH8Q9H579 483 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 CYTH3O43739 400 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ERCC3P19447 782 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 PSMC4P43686 418 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 SCRN1Q12765 414 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 TKFCQ3LXA3 575 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 USH1GQ495M9 461 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 COA7Q96BR5 231 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 AMNQ9BXJ7 453 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 PORCNQ9H237 461 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 EFCC1Q9HA90 598 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 FBXO40Q9UH90 709 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 HOXD10P28358 340 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 NECAB1Q8N987 351 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 CHST13Q8NET6 341 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 GTF3C6Q969F1 213 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 MTMR8Q96EF0 704 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRERF1Q96PN7 1200 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 RNF146Q9NTX7 359 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF536O15090 1300 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ABCB11O95342 1321 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 LARGE1O95461 756 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 IFNAR1P17181 557 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 KCTD2Q14681 263 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 GPR142Q7Z601 462 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 PHKBQ93100 1093 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 171.4 ms