RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557623.5

SLIRP-211, Transcript of SRA stem-loop interacting RNA binding protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLIRP, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRP-211ENST00000557623 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.66□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.66□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 MYH6P13533 1939 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 ERICH2A1L162 156 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 HMGCRP04035 888 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 PDHBP11177 359 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 ELNP15502 786 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 SOX10P56693 466 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 GRB14Q14449 540 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 NECTIN1Q15223 517 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 PNMA1Q8ND90 353 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIRP-211ENST00000557623 SLC27A2O14975 620 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 INHAP05111 366 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 FCER1AP12319 257 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 RGS19P49795 217 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 CPXCR1Q8N123 301 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 POTEB2H3BUK9 544 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 HOXC6P09630 235 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 SNHG28P0DPA3 235 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 ZNF543Q08ER8 600 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 DPP9Q86TI2 863 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 MMP19Q99542 508 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 MTA3Q9BTC8 594 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 FBXO40Q9UH90 709 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 REC8O95072 547 aa14.62□□□□□ -0.07
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SLIRP-211ENST00000557623 CAPN2P17655 700 aa14.62□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 ADORA2AP29274 412 aa14.62□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 KCTD2Q14681 263 aa14.62□□□□□ -0.07
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SLIRP-211ENST00000557623 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14.62□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 CHST13Q8NET6 341 aa14.62□□□□□ -0.07
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SLIRP-211ENST00000557623 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.61□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.61□□□□□ -0.07
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SLIRP-211ENST00000557623 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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SLIRP-211ENST00000557623 KRT32Q14532 448 aa14.6□□□□□ -0.07
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SLIRP-211ENST00000557623 TMEM87BQ96K49 555 aa14.6□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.6□□□□□ -0.07
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SLIRP-211ENST00000557623 HTTP42858 3142 aa14.59□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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SLIRP-211ENST00000557623 TMTC2Q8N394 836 aa14.59□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.59□□□□□ -0.07
SLIRP-211ENST00000557623 DDX11Q96FC9 970 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLIRP-211ENST00000557623 ACAD9Q9H845 621 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLIRP-211ENST00000557623 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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