RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 GRIN2DO15399 1336 aa16.57■□□□□ 0.24
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CS-231ENST00000552222 STAT3P40763 770 aa16.57■□□□□ 0.24
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CS-231ENST00000552222 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
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CS-231ENST00000552222 SLC25A27O95847 323 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 CCDC174Q6PII3 467 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 ECHDC1Q9NTX5 307 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.55■□□□□ 0.24
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CS-231ENST00000552222 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 PRKAB2O43741 272 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 ICA1Q05084 483 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 ACVR2BQ13705 512 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 AAK1Q2M2I8 961 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 GPATCH3Q96I76 525 aa16.54■□□□□ 0.24
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CS-231ENST00000552222 TMEM179Q6ZVK1 233 aa16.53■□□□□ 0.24
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CS-231ENST00000552222 DEFB128Q7Z7B8 93 aa16.53■□□□□ 0.24
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CS-231ENST00000552222 UIMC1Q96RL1 719 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.52■□□□□ 0.24
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CS-231ENST00000552222 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.52■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CS-231ENST00000552222 TSHZ3Q63HK5 1081 aa16.52■□□□□ 0.24
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CS-231ENST00000552222 DDX11Q96FC9 970 aa16.52■□□□□ 0.24
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CS-231ENST00000552222 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.52■□□□□ 0.24
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CS-231ENST00000552222 PDE1AP54750 535 aa16.51■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 GRB10Q13322 594 aa16.51■□□□□ 0.23
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CS-231ENST00000552222 KATNBL1Q9H079 304 aa16.51■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.51■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 MCM3APO60318 1980 aa16.51■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 PDE4AP27815 886 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 CNTN2Q02246 1040 aa16.5■□□□□ 0.23
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