RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	ETFB	P38117	255 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	EPS15	P42566	896 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	GYS2	P54840	703 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	BIRC2	Q13490	618 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	TLR1	Q15399	786 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	CRY2	Q49AN0	593 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	EFHC2	Q5JST6	749 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	ODR4	Q5SWX8	454 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	TREML1	Q86YW5	311 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	GPC2	Q8N158	579 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	RELT	Q969Z4	430 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	FEZ1	Q99689	392 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	NYX	Q9GZU5	481 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	TRAF5	O00463	557 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	PLIN1	O60240	522 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	NTSR2	O95665	410 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	NEFM	P07197	916 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	NOS2	P35228	1153 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	SOX9	P48436	509 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	LBX1	P52954	281 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	AMPD3	Q01432	767 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	GRM1	Q13255	1194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	LRP8	Q14114	963 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	AOC3	Q16853	763 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	PROSER3	Q2NL68	480 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	PMEPA1	Q969W9	287 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	AIDA	Q96BJ3	306 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	TAF1	P21675	1872 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	LAMB2	P55268	1798 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	ABCC4	O15439	1325 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	RASSF10	A6NK89	507 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	EML1	O00423	815 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	PPIP5K2	O43314	1243 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	PHACTR2	O75167	634 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	TNFRSF21	O75509	655 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	MSX1	P28360	303 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	RIPK4	P57078	832 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	CENPC	Q03188	943 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	RASA3	Q14644	834 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	TCEA2	Q15560	299 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	XKR5	Q6UX68	686 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	XAGE2	Q96GT9	111 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	C8orf48	Q96LL4	319 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM74	Q96NL1	305 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	CRBN	Q96SW2	442 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	BCO2	Q9BYV7	579 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	COPRS	Q9NQ92	184 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	GINM1	Q9NU53	330 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	KLK14	Q9P0G3	267 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SBF2-208	ENST00000528478	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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