RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527871.5

RPS2-208, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-208	ENST00000527871	FAM227B	Q96M60	508 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	KATNBL1	Q9H079	304 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	SLC1A4	P43007	532 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	FAM160B2	Q86V87	743 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	STX8	Q9UNK0	236 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	MCM3AP	O60318	1980 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	MYADML2	A6NDP7	307 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	TSPY2	A6NKD2	308 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	ORC4	O43929	436 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	FGA	P02671	866 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	ACLY	P53396	1101 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	CNTN2	Q02246	1040 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	KCTD1	Q719H9	257 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	TICAM2	Q86XR7	235 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871		A0A0D9SFI3	127 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	ARMCX2	Q7L311	632 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RPS2-208	ENST00000527871	KCNA10	Q16322	511 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	ACAD9	Q9H845	621 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	CDH23	Q9H251	3354 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	KIAA0355	O15063	1070 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	SMC5	Q8IY18	1101 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	TOX2	Q96NM4	488 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	CTAGE5	O15320	804 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	CLTB	P09497	229 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	SNAP25	P60880	206 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	FAAP100	Q0VG06	881 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	RNF146	Q9NTX7	359 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	ASTN1	O14525	1302 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	GJA9	P57773	515 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	NKX3-2	P78367	333 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	TKFC	Q3LXA3	575 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	LNPK	Q9C0E8	428 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	CDK7	P50613	346 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	EPHB4	P54760	987 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	GUCD1	Q96NT3	240 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
RPS2-208	ENST00000527871	ELP1	O95163	1332 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	ZMYM6	O95789	1325 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	ALAS1	P13196	640 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	AAMP	Q13685	434 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC174	Q6PII3	467 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	ASGR1	P07306	291 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	DCAF4	Q8WV16	495 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	IGHD	P01880	384 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	RAG1	P15918	1043 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RPS2-208	ENST00000527871	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		28.73	■■■□□ 2.19

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