RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTS4O75173 837 aa30.97■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGRP09769 529 aa30.97■■■□□ 2.55
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.97■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACAD9Q9H845 621 aa30.97■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LTBP2Q14767 1821 aa30.96■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACVR2BQ13705 512 aa30.96■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RILPL2Q969X0 211 aa30.96■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGD4Q96M96 766 aa30.96■■■□□ 2.55
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa30.96■■■□□ 2.55
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PQY0 241 aa30.95■■■□□ 2.55
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLE2Q04725 743 aa30.95■■■□□ 2.55
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa30.95■■■□□ 2.55
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR12Q9ULL5 1215 aa30.94■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMYM6O95789 1325 aa30.94■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC171Q6TFL3 1326 aa30.94■■■□□ 2.54
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTN2Q02246 1040 aa30.93■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC174Q6PII3 467 aa30.93■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARMCX2Q7L311 632 aa30.93■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASGRP2Q7LDG7 609 aa30.93■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHD1LQ86WJ1 897 aa30.93■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCAF4Q8WV16 495 aa30.93■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRERF1Q96PN7 1200 aa30.93■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALAS1P13196 640 aa30.92■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACLYP53396 1101 aa30.92■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNAP25P60880 206 aa30.92■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC96Q2M329 555 aa30.92■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q7L0L9 218 aa30.92■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa30.92■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa30.92■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM133AQ8N9E0 248 aa30.92■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHDC9Q8NEP7 349 aa30.92■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM43BA6NCK2 446 aa30.91■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC144BQ3MJ40 725 aa30.91■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BADQ92934 168 aa30.91■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCM3APO60318 1980 aa30.91■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOXD2PA6NHM9 499 aa30.9■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHDP01880 384 aa30.9■■■□□ 2.54
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAND2P61296 217 aa30.9■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNA10Q16322 511 aa30.9■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP133Q8WUM0 1156 aa30.9■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPC25Q9HBM1 224 aa30.9■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STARD7Q9NQZ5 370 aa30.9■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa30.9■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLTBP09497 229 aa30.89■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDSP20132 328 aa30.89■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUCB1Q02818 461 aa30.89■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa30.89■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EXOC6Q8TAG9 804 aa30.89■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM47Q9BQJ4 181 aa30.89■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSBPL3Q9H4L5 887 aa30.89■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADCY6O43306 1168 aa30.88■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCPG1Q9ULG6 757 aa30.88■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYADML2A6NDP7 307 aa30.87■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOWAHBA6NEL2 793 aa30.87■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCP11498 1178 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CST5P28325 142 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD6Q6ZSS7 791 aa30.87■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KATNBL1Q9H079 304 aa30.87■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASB14A6NK59 587 aa30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ICAM1P05362 532 aa30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC16A2P36021 539 aa30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJA9P57773 515 aa30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHHQ15465 462 aa30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUM1L1Q5H9M0 696 aa30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKNAD1Q5T1N1 836 aa30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTBK2Q6IQ55 1244 aa30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTNL9Q6UXG8 535 aa30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYDE2Q5VT97 1194 aa30.85■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa30.85■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLT1D1Q96MS3 346 aa30.85■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTMR10Q9NXD2 777 aa30.85■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP39A1Q9NYL5 469 aa30.85■■■□□ 2.53
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