RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 IRF2BP1Q8IU81 584 aa16.72■□□□□ 0.27
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TOP3B-206ENST00000436282 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa16.72■□□□□ 0.27
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TOP3B-206ENST00000436282 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.72■□□□□ 0.27
TOP3B-206ENST00000436282 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.72■□□□□ 0.27
TOP3B-206ENST00000436282 CAGE1Q8TC20 777 aa16.72■□□□□ 0.27
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TOP3B-206ENST00000436282 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 CCDC70Q6NSX1 233 aa16.7■□□□□ 0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 UBE4AQ14139 1066 aa16.69■□□□□ 0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.68■□□□□ 0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 RUBCNQ92622 972 aa16.68■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 DEF6Q9H4E7 631 aa16.68■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.68■□□□□ 0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 EBAG9O00559 213 aa16.68■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF185O15231 689 aa16.68■□□□□ 0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 CCT5P48643 541 aa16.68■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 C2orf54Q08AI8 447 aa16.68■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 FAM182BQ5T319 152 aa16.68■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 GBP6Q6ZN66 633 aa16.68■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf37Q96NL8 207 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CALM1P0DP23 149 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CALM2P0DP24 149 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CALM3P0DP25 149 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SRGNP10124 158 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SKIDA1Q1XH10 827 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 BARGINQ6ZT62 677 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 NUP58Q9BVL2 599 aa16.67■□□□□ 0.26
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