RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.18■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 ALAS1P13196 640 aa20.17■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 CCDC174Q6PII3 467 aa20.17■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.17■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 RNF180Q86T96 592 aa20.17■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.17■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.17■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 PNMA2Q9UL42 364 aa20.17■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 RAD50Q92878 1312 aa20.17■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 A0A1W2PPC1 479 aa20.16■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 POTEB2H3BUK9 544 aa20.16■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.16■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.16■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 KRT23Q9C075 422 aa20.16■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.16■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 NEDD4P46934 1319 aa20.16■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.16■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 ICAM1P05362 532 aa20.15■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.15■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.15■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.15■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 DGKHQ86XP1 1220 aa20.15■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.15■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.15■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 ZNF536O15090 1300 aa20.15■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 ALPK3Q96L96 1907 aa20.15■□□□□ 0.82
USP11-202ENST00000377078 LAMA4Q16363 1823 aa20.14■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 KDM4AO75164 1064 aa20.14■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 PDHBP11177 359 aa20.14■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 LRRC41Q15345 812 aa20.14■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.14■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.14■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 SYN1P17600 705 aa20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 SLC16A2P36021 539 aa20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 SNAP25P60880 206 aa20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ZNF543Q08ER8 600 aa20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 KAT14Q9H8E8 782 aa20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 SPC25Q9HBM1 224 aa20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.12■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ASB14A6NK59 587 aa20.12■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 B4E1Z4 1266 aa20.12■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 TRDNQ13061 729 aa20.12■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ACVR2BQ13705 512 aa20.12■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.12■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ARMCX2Q7L311 632 aa20.12■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.12■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 PRO3102Q9H379 93 aa20.12■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 SNHG28P0DPA3 235 aa20.11■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 BMP8BP34820 402 aa20.11■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.11■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 NSMFQ6X4W1 530 aa20.11■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.11■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 PNMA1Q8ND90 353 aa20.11■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 PGK1P00558 417 aa20.1■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 CHMLP26374 656 aa20.1■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 RTP1P59025 263 aa20.1■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 CNTN2Q02246 1040 aa20.1■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.1■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 GDF15Q99988 308 aa20.1■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 PHF24Q9UPV7 400 aa20.1■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.1■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.09■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.09■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ANKS1AQ92625 1134 aa20.09■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 FERMT2Q96AC1 680 aa20.09■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.09■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.09■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 TNKSO95271 1327 aa20.08■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.08■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.08■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 FGD4Q96M96 766 aa20.08■□□□□ 0.81
USP11-202ENST00000377078 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.3 ms