RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 GMCL1Q96IK5 515 aa21.35■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 MTA3Q9BTC8 594 aa21.35■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.35■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 ATP2A1O14983 1001 aa21.34■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.34■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 LHX8Q68G74 356 aa21.34■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.34■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.34■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.34■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 ST18O60284 1047 aa21.33■■□□□ 1.01
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PTX4-201ENST00000293922 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 CHST3Q7LGC8 479 aa21.33■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 TMEM87BQ96K49 555 aa21.33■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.33■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 MMP19Q99542 508 aa21.33■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.33■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.33■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 RIPK3Q9Y572 518 aa21.33■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 TMEM232C9JQI7 657 aa21.32■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 ZBED4O75132 1171 aa21.32■■□□□ 1
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PTX4-201ENST00000293922 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.32■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 TRPV1Q8NER1 839 aa21.32■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.32■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.32■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.32■■□□□ 1
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PTX4-201ENST00000293922 CYBAP13498 195 aa21.31■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 STAT2P52630 851 aa21.31■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 IQCA1Q86XH1 822 aa21.31■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 CPXCR1Q8N123 301 aa21.31■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 DPF3Q92784 378 aa21.31■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 SNX21Q969T3 373 aa21.31■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 MAML3Q96JK9 1138 aa21.31■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 AK2P54819 239 aa21.3■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 KCTD2Q14681 263 aa21.3■■□□□ 1
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PTX4-201ENST00000293922 Q6ZUG5 572 aa21.3■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 KCTD1Q719H9 257 aa21.3■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.3■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.3■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.3■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.3■■□□□ 1
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PTX4-201ENST00000293922 H0YGN5 161 aa21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 PLA2G6O60733 806 aa21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 MCM2P49736 904 aa21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 FAM160B2Q86V87 743 aa21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.29■■□□□ 1
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PTX4-201ENST00000293922 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.29■■□□□ 1
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PTX4-201ENST00000293922 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 FDX1P10109 184 aa21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 OAZ1P54368 228 aa21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 SEC23AQ15436 765 aa21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 TNKSO95271 1327 aa21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 CNGA1P29973 690 aa21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 LIFRP42702 1097 aa21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 FGD1P98174 961 aa21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 DCAF4Q8WV16 495 aa21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 ANKS1AQ92625 1134 aa21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 LY9Q9HBG7 655 aa21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 MTMR7Q9Y216 660 aa21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 ERICH2A1L162 156 aa21.27■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 MSCO60682 206 aa21.27■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 SLC4A3P48751 1232 aa21.27■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 EVCP57679 992 aa21.27■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.27■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 DGKHQ86XP1 1220 aa21.27■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 BRF1Q92994 677 aa21.27■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.27■■□□□ 1
PTX4-201ENST00000293922 ZNF536O15090 1300 aa21.27■□□□□ 0.99
PTX4-201ENST00000293922 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.26■□□□□ 0.99
PTX4-201ENST00000293922 WTAPQ15007 396 aa21.26■□□□□ 0.99
PTX4-201ENST00000293922 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.26■□□□□ 0.99
PTX4-201ENST00000293922 TMTC2Q8N394 836 aa21.26■□□□□ 0.99
PTX4-201ENST00000293922 TINF2Q9BSI4 451 aa21.26■□□□□ 0.99
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