RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639221.1

SLC35A3-216, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-216ENST00000639221 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 KAT14Q9H8E8 782 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 ABRAQ8N0Z2 381 aa26.34■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.34■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 RNF208Q9H0X6 261 aa26.34■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 ERICH2A1L162 156 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 CYP21A2P08686 494 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 CCL5P13501 91 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 CAPN2P17655 700 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 OAZ1P54368 228 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 GRB14Q14449 540 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 KCTD2Q14681 263 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 KCTD1Q719H9 257 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 CPXCR1Q8N123 301 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 NCOA7Q8NI08 942 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC35A3-216ENST00000639221 ATP2A1O14983 1001 aa26.32■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 RNF20Q5VTR2 975 aa26.32■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 USP6NLQ92738 828 aa26.32■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.32■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 A0A0G2JMZ2 1700 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 MFSD14CQ5VZR4 134 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 ANKS1AQ92625 1134 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 MMP19Q99542 508 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 FBXO40Q9UH90 709 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 RLFQ13129 1914 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 GJB1P08034 283 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 HOXC6P09630 235 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 ADORA2AP29274 412 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 SLC4A3P48751 1232 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 MTFR1Q15390 333 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 PNMA1Q8ND90 353 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 REPS2Q8NFH8 660 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 TNKSO95271 1327 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 DOCK3Q8IZD9 2030 aa26.29■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 E7EWF7 191 aa26.29■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 TRIB2Q92519 343 aa26.29■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 PNMA2Q9UL42 364 aa26.29■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 POTEFA5A3E0 1075 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 PDHBP11177 359 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 UNC93B1Q9H1C4 597 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 RPTORQ8N122 1335 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 CHST13Q8NET6 341 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 DDX11Q96FC9 970 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC35A3-216ENST00000639221 PARP14Q460N5 1801 aa26.26■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF543Q08ER8 600 aa26.26■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 TKFCQ3LXA3 575 aa26.26■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 SYDE2Q5VT97 1194 aa26.26■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.26■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 EN2P19622 333 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 GJA8P48165 433 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 SNHG28P0DPA3 235 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 CCL14Q16627 93 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 OLFML2BQ68BL8 750 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 ANKRD35Q8N283 1001 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 HTTP42858 3142 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 SLC27A2O14975 620 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 SGPL1O95470 568 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 TFRCP02786 760 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 WTAPQ15007 396 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC174Q6PII3 467 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 DEFB118Q96PH6 123 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 ACAD9Q9H845 621 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 REC8O95072 547 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 MCM5P33992 734 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 SLC16A2P36021 539 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 NECTIN1Q15223 517 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 NPLOC4Q8TAT6 608 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 MTA3Q9BTC8 594 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 CCPG1Q9ULG6 757 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 RIPK3Q9Y572 518 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 PLXNB2O15031 1838 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC35A3-216ENST00000639221 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms