RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 GRAPQ13588 217 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.95■■□□□ 1.26
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PTPRJ-208ENST00000615445 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC114Q96M63 670 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP2C2O75185 946 aa22.95■■□□□ 1.26
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PTPRJ-208ENST00000615445 CA8P35219 290 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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PTPRJ-208ENST00000615445 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 GDF11O95390 407 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 LIN9Q5TKA1 542 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 IWS1Q96ST2 819 aa22.89■■□□□ 1.26
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