RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592052.1

TMEM259-208, Transcript of transmembrane protein 259, human

Gene TMEM259, Length 1,637 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-208	ENST00000592052	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	WBP1L	Q9NX94	342 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	KLRF2	D3W0D1	207 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	ST18	O60284	1047 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	LBX2	Q6XYB7	198 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	TLR2	O60603	784 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	SLC16A2	P36021	539 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	28.86	■■■□□ 2.21	2e-9	■■■□□ 15.4
TMEM259-208	ENST00000592052	GNAQ	P50148	359 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	ATG4C	Q96DT6	458 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	TBC1D8	O95759	1140 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	PPP2R5B	Q15173	497 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	RTN1	Q16799	776 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	MB21D1	Q8N884	522 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	VWA5A	O00534	786 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	FDX1	P10109	184 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	NID2	Q14112	1375 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	ZBED4	O75132	1171 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	CPVL	Q9H3G5	476 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	CPA4	Q9UI42	421 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	RLF	Q13129	1914 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	STK3	Q13188	491 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	C17orf99	Q6UX52	265 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	PARP14	Q460N5	1801 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	SMARCA1	P28370	1054 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	BCR	P11274	1271 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	CDC27	P30260	824 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	BTBD7	Q9P203	1132 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	NBPF11	Q86T75	865 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	PFKFB2	O60825	505 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	CNMD	O75829	334 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	MCM2	P49736	904 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	ERVK-9	P63128	1117 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	ERVK-24	P63145	666 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	ME3	Q16798	604 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	REPS2	Q8NFH8	660 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	SNAP25	P60880	206 aa		28.76	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	PLS1	Q14651	629 aa		28.76	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		28.76	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.2
TMEM259-208	ENST00000592052		A0A0G2JMZ2	1700 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	CYTH3	O43739	400 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	PEX10	O60683	326 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	OAZ1	P54368	228 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	TSKS	Q9UJT2	592 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	ATP2A1	O14983	1001 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	CCDC174	Q6PII3	467 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	CPXCR1	Q8N123	301 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
TMEM259-208	ENST00000592052	GPR25	O00155	361 aa		28.74	■■■□□ 2.19

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