RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585970.1

NEDD4L-213, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 487 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-213	ENST00000585970	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	BIN1	O00499	593 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	FAM168A	Q92567	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	CD247	P20963	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	LTK	P29376	864 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	EGR3	Q06889	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-213	ENST00000585970	MEIS1	O00470	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZNF445	P59923	1031 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	BRF1	Q92994	677 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	HAUS7	Q99871	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	CTSK	P43235	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	TEK	Q02763	1124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	EPHX1	P07099	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	SYP	P08247	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	ITGA4	P13612	1032 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	FGD4	Q96M96	766 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970		A0A087WZG4	1122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970		B2RBV5	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970		H0Y8X5	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	KLF4	O43474	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	BMP8B	P34820	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	GDNF	P39905	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	HK2	P52789	917 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	NCAPH	Q15003	741 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	FXN	Q16595	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-213	ENST00000585970	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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