RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 KIFC2Q96AC6 838 aa28.53■■■□□ 2.16
PITX3-202ENST00000539804 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
PITX3-202ENST00000539804 PNMA2Q9UL42 364 aa28.53■■■□□ 2.16
PITX3-202ENST00000539804 FBXO40Q9UH90 709 aa28.52■■■□□ 2.16
PITX3-202ENST00000539804 PARP14Q460N5 1801 aa28.52■■■□□ 2.16
PITX3-202ENST00000539804 TMEM232C9JQI7 657 aa28.51■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 EN2P19622 333 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 MCCP23508 829 aa28.51■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 KCTD2Q14681 263 aa28.51■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 TRIB2Q92519 343 aa28.51■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa28.51■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 NMT2O60551 498 aa28.5■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 SGPL1O95470 568 aa28.5■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 ADORA2AP29274 412 aa28.5■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 MMP19Q99542 508 aa28.5■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 NBPF3Q9H094 633 aa28.5■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 UNC93B1Q9H1C4 597 aa28.5■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 ZNF236Q9UL36 1845 aa28.5■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 PLXNB2O15031 1838 aa28.49■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 OLFML2BQ68BL8 750 aa28.49■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 REPS2Q8NFH8 660 aa28.49■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 TMEM47Q9BQJ4 181 aa28.49■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 UBAC1Q9BSL1 405 aa28.49■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 TACC3Q9Y6A5 838 aa28.49■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 NEDD4P46934 1319 aa28.48■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 KDM4AO75164 1064 aa28.48■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 CCDC96Q2M329 555 aa28.48■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa28.48■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 CHST13Q8NET6 341 aa28.48■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 CENPFP49454 3210 aa28.47■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 TKFCQ3LXA3 575 aa28.47■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 KAT14Q9H8E8 782 aa28.47■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 MSCO60682 206 aa28.46■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 TFRCP02786 760 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
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PITX3-202ENST00000539804 ANKLE1Q8NAG6 615 aa28.46■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 ANKS1AQ92625 1134 aa28.46■■■□□ 2.15
PITX3-202ENST00000539804 B4E1Z4 1266 aa28.45■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 SART3Q15020 963 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 CPXCR1Q8N123 301 aa28.45■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 MAP4K1Q92918 833 aa28.45■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 DEFB118Q96PH6 123 aa28.45■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 ERICH2A1L162 156 aa28.44■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 BTNL9Q6UXG8 535 aa28.44■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 KCTD1Q719H9 257 aa28.44■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 ZSWIM5Q9P217 1185 aa28.44■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 NRBP1Q9UHY1 535 aa28.44■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
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PITX3-202ENST00000539804 DDX11Q96FC9 970 aa28.43■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.43■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa28.43■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 IL25Q9H293 177 aa28.43■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 PDHBP11177 359 aa28.42■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 HTATIP2Q9BUP3 242 aa28.42■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 MTMR7Q9Y216 660 aa28.42■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 CYP21A2P08686 494 aa28.41■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 PTH1RQ03431 593 aa28.41■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 CCL14Q16627 93 aa28.41■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 PNMA1Q8ND90 353 aa28.41■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 NPLOC4Q8TAT6 608 aa28.41■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 PRR12Q9ULL5 1215 aa28.41■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 TNKSO95271 1327 aa28.41■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 CDC45O75419 566 aa28.4■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 SNHG28P0DPA3 235 aa28.4■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 SYDE2Q5VT97 1194 aa28.4■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 RNF20Q5VTR2 975 aa28.4■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD35Q8N283 1001 aa28.4■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.4■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 ACAD9Q9H845 621 aa28.4■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 ZNF543Q08ER8 600 aa28.39■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 ASPRV1Q53RT3 343 aa28.39■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 SHISA4Q96DD7 197 aa28.39■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 MAML3Q96JK9 1138 aa28.39■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 MTA3Q9BTC8 594 aa28.39■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.39■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
PITX3-202ENST00000539804 COBLO75128 1261 aa28.38■■■□□ 2.13
PITX3-202ENST00000539804 SLC4A3P48751 1232 aa28.38■■■□□ 2.13
PITX3-202ENST00000539804 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
PITX3-202ENST00000539804 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
PITX3-202ENST00000539804 PFASO15067 1338 aa28.38■■■□□ 2.13
PITX3-202ENST00000539804 ICAM1P05362 532 aa28.37■■■□□ 2.13
PITX3-202ENST00000539804 TRIM32Q13049 653 aa28.37■■■□□ 2.13
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