RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498163.1

RPL23AP55-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 55, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP55, Length 452 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP55-201ENST00000498163 CREB3O43889 395 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 SUSD5O60279 629 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 ADAM23O75077 832 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 DDAH1O94760 285 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRNPP04156 253 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 EPHX1P07099 455 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 CD247P20963 164 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 CD97P48960 835 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 TCEAL1Q15170 157 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 SLC10A6Q3KNW5 377 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 EEPD1Q7L9B9 569 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 HDAC8Q9BY41 377 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRDM14Q9GZV8 571 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PIF1Q9H611 641 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 GP6Q9HCN6 339 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 FHOD1Q9Y613 1164 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa4.87□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 SHISA3A0PJX4 238 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PDPK1O15530 556 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 CBX7O95931 251 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 NAT2P11245 290 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 SPINK2P20155 84 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZNF445P59923 1031 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 TMC3Q7Z5M5 1100 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 CCDC146Q8IYE0 955 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 RELTQ969Z4 430 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PCDH12Q9NPG4 1184 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 ST7Q9NRC1 585 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 SLC52A1Q9NWF4 448 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 WHRNQ9P202 907 aa4.86□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 TP53P04637 393 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRKCQQ04759 706 aa4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 LONRF3Q496Y0 759 aa4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 DTX1Q86Y01 620 aa4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 MISP3Q96FF7 219 aa4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 SGSM3Q96HU1 749 aa4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 CEP89Q96ST8 783 aa4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 APEX2Q9UBZ4 518 aa4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 VAV3Q9UKW4 847 aa4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.85□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 COBLO75128 1261 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 MED26O95402 600 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRAMEF1O95521 474 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 ITGA4P13612 1032 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 ITIH2P19823 946 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 GRIK1P39086 918 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 CTSKP43235 329 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 CHMP4BP1P59074 171 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PLEKHG6Q3KR16 790 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 JAZF1Q86VZ6 243 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 MRGPRX3Q96LB0 322 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 HSPA12BQ96MM6 686 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 APBA2Q99767 749 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PLCD4Q9BRC7 762 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 GBP3Q9H0R5 595 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 TERF2IPQ9NYB0 399 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZMYM5Q9UJ78 669 aa4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRC1O43663 620 aa4.83□□□□□ -1.64
RPL23AP55-201ENST00000498163 SH3BP5O60239 455 aa4.83□□□□□ -1.64
RPL23AP55-201ENST00000498163 PLIN1O60240 522 aa4.83□□□□□ -1.64
RPL23AP55-201ENST00000498163 ADCY3O60266 1144 aa4.83□□□□□ -1.64
RPL23AP55-201ENST00000498163 PPM1BO75688 479 aa4.83□□□□□ -1.64
RPL23AP55-201ENST00000498163 GRB10Q13322 594 aa4.83□□□□□ -1.64
RPL23AP55-201ENST00000498163 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RPL23AP55-201ENST00000498163 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.83□□□□□ -1.64
RPL23AP55-201ENST00000498163 STK11IPQ8N1F8 1099 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.6 ms