RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 USP49Q70CQ1 688 aa15.14■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ZNF384Q8TF68 577 aa15.14■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 VIPAS39Q9H9C1 493 aa15.14■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 N4BP3O15049 544 aa15.14■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MCM3P25205 808 aa15.14■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 CASP1P29466 404 aa15.14■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 USP14P54578 494 aa15.14■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ZNF654Q8IZM8 581 aa15.14■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MMS19Q96T76 1030 aa15.14■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 PLCD1P51178 756 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 PARP10Q53GL7 1025 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 SLC51AQ86UW1 340 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 TMTC1Q8IUR5 882 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 FAM212AQ96EL1 285 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 VPS16Q9H269 839 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 SUFUQ9UMX1 484 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 TNKSO95271 1327 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 STK36Q9NRP7 1315 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 KIAA0754O94854 1291 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MORC3Q14149 939 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 FKBP15Q5T1M5 1219 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 FANCBQ8NB91 859 aa15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 GYPCP04921 128 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 GBP6Q6ZN66 633 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 TFR2Q9UP52 801 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 SELENOOQ9BVL4 669 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 JAG2Q9Y219 1238 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 SAR1BQ9Y6B6 198 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ERICH2A1L162 156 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 WNT7AO00755 349 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 NDUFAB1O14561 156 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 KRT9P35527 623 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 GSCP56915 257 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ERVK-24P63145 666 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 OTUD6BQ8N6M0 293 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 GIMAP7Q8NHV1 300 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 CENPHQ9H3R5 247 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 CABP5Q9NP86 173 aa15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 GNAT2P19087 354 aa15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 SPATA1Q5VX52 437 aa15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 CYP26C1Q6V0L0 522 aa15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ZEB2O60315 1214 aa15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHA8P1O95397 391 aa15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 SEC23AQ15436 765 aa15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 POTEDQ86YR6 584 aa15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.11■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MYO1FO00160 1098 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MYBL2P10244 700 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 CHP1Q99653 195 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 POLD4Q9HCU8 107 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 NMT2O60551 498 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ARHGAP25P42331 645 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 PPFIA1Q13136 1202 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 STAMQ92783 540 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 RUFY1Q96T51 708 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 JADE2Q9NQC1 790 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 CACNA1SQ13698 1873 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 DEXIO95424 95 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 ABHD10Q9NUJ1 306 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 DONSONQ9NYP3 566 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MINPP1Q9UNW1 487 aa15.1■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 MYH6P13533 1939 aa15.09■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 NID2Q14112 1375 aa15.09■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 AMPD2Q01433 879 aa15.09■□□□□ 0.01
NISCH-212ENST00000488380 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms