RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARMC5Q96C12 935 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC25A27O95847 323 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERCC3P19447 782 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRK4P32298 578 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COPB2P35606 906 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 REPS2Q8NFH8 660 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MROH8Q9H579 483 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADCY3O60266 1144 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNHG28P0DPA3 235 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STAT3P40763 770 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEC23AQ15436 765 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GJD2Q9UKL4 321 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RLFQ13129 1914 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTPREP23469 700 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGS2P41220 211 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OAZ1P54368 228 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF543Q08ER8 600 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MORN1Q5T089 497 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP2A1O14983 1001 aa20.33■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STRNO43815 780 aa20.33■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MCM5P33992 734 aa20.33■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRB14Q14449 540 aa20.33■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WTAPQ15007 396 aa20.33■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.33■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHST3Q7LGC8 479 aa20.33■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPXCR1Q8N123 301 aa20.33■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF333Q96JL9 665 aa20.33■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APBA2Q99767 749 aa20.33■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.33■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MGAMO43451 1857 aa20.33■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BRCA2P51587 3418 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRC1O43663 620 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ELNP15502 786 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYP2B6P20813 491 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANTXR2P58335 489 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBXN2AP68543 259 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP2K5Q13163 448 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRT32Q14532 448 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTA3Q9BTC8 594 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PARP14Q460N5 1801 aa20.32■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC16A2P36021 539 aa20.31■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.31■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.31■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP6NLQ92738 828 aa20.31■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM87BQ96K49 555 aa20.31■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POTEFA5A3E0 1075 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FCER1AP12319 257 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADORA2AP29274 412 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSPA4P34932 840 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC4A3P48751 1232 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCTD2Q14681 263 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEK1Q96PY6 1258 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MMP19Q99542 508 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HMGCRP04035 888 aa20.29■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INHAP05111 366 aa20.29■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC174Q6PII3 467 aa20.29■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.29■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DPP9Q86TI2 863 aa20.29■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RASEFQ8IZ41 740 aa20.29■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.29■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO40Q9UH90 709 aa20.29■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXC6P09630 235 aa20.28■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNAP25P60880 206 aa20.28■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMTC2Q8N394 836 aa20.28■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHST13Q8NET6 341 aa20.28■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIB2Q92519 343 aa20.28■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.28■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LY9Q9HBG7 655 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms