RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 FAM181AQ8N9Y4 354 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 EXOC2Q96KP1 924 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SPOCK3Q9BQ16 436 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 DSCC1Q9BVC3 393 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 HDAC8Q9BY41 377 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 GPR62Q9BZJ7 368 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CHST7Q9NS84 486 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 ATG3Q9NT62 314 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 MINPP1Q9UNW1 487 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 ST14Q9Y5Y6 855 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD62A6NC57 917 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 H0Y8X5 98 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 KCNH1O95259 989 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 ASMTLO95671 621 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 FGFR1P11362 822 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 ITIH2P19823 946 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 GRIA2P42262 883 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CTSKP43235 329 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PPP2R5DQ14738 602 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 TCEA2Q15560 299 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 TKFCQ3LXA3 575 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 BTN2A2Q8WVV5 523 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 ZDHHC15Q96MV8 337 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 FEZ1Q99689 392 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 MEIS1O00470 390 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 MSTNO14793 375 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 DYRK3O43781 588 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 GSNP06396 782 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 L1CAMP32004 1257 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CLCN7P51798 805 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 AMPD2Q01433 879 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 FAM209AQ5JX71 171 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CRTC3Q6UUV7 619 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SLC51AQ86UW1 340 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SCUBE1Q8IWY4 988 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 OSBP2Q969R2 916 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CDC6Q99741 560 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 IER2Q9BTL4 223 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 DHRS4Q9BTZ2 278 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PLAGL2Q9UPG8 496 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CYP26A1O43174 497 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PRODHO43272 600 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 VAMP4O75379 141 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 NCLP19338 710 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 HOXC12P31275 282 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 BMP8BP34820 402 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 GFRA1P56159 465 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 POU4F1Q01851 419 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CDKAL1Q5VV42 579 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 NSMFQ6X4W1 530 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 NETO1Q8TDF5 533 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 TCTN2Q96GX1 697 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PIM2Q9P1W9 311 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CD2APQ9Y5K6 639 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PRR19A6NJB7 356 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 H3BS24 57 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 DLX3O60479 287 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SCG5P05408 212 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CD3EP07766 207 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 FOSL1P15407 271 aa4.53□□□□□ -1.68
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