RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 NDUFB10O96000 172 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTX4-201ENST00000293922 RABEP1Q15276 862 aa21.44■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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PTX4-201ENST00000293922 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTX4-201ENST00000293922 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTX4-201ENST00000293922 IL27Q8NEV9 243 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 NCOA7Q8NI08 942 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 KRT23Q9C075 422 aa21.42■■□□□ 1.02
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PTX4-201ENST00000293922 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 REPS2Q8NFH8 660 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 STRNO43815 780 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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PTX4-201ENST00000293922 TSPY2A6NKD2 308 aa21.39■■□□□ 1.02
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PTX4-201ENST00000293922 FEM1BQ9UK73 627 aa21.36■■□□□ 1.01
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PTX4-201ENST00000293922 BMP3P12645 472 aa21.35■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 CYP2C19P33261 490 aa21.35■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 FBXL16Q8N461 479 aa21.35■■□□□ 1.01
PTX4-201ENST00000293922 KIFC2Q96AC6 838 aa21.35■■□□□ 1.01
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