RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262197.7

RBFA-201, Transcript of ribosome binding factor A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RBFA, Length 1,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFA-201ENST00000262197 ATG4CQ96DT6 458 aa27.96■■■□□ 2.07
RBFA-201ENST00000262197 MAP3K14Q99558 947 aa27.96■■■□□ 2.07
RBFA-201ENST00000262197 MYH6P13533 1939 aa27.95■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 CCNA1P78396 465 aa27.95■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 TROAPQ12815 778 aa27.95■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 GRM4Q14833 912 aa27.95■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 BRF1Q92994 677 aa27.95■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 A0A0G2JMZ2 1700 aa27.95■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 MGAMO43451 1857 aa27.94■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 ARHGEF6Q15052 776 aa27.94■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 BTNL9Q6UXG8 535 aa27.94■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 ERO1AQ96HE7 468 aa27.94■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 MORF4L1Q9UBU8 362 aa27.94■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa27.94■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa27.93■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 VWA5AO00534 786 aa27.93■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 GOLGA8HP0CJ92 632 aa27.93■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 LBX1P52954 281 aa27.93■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 ERVK-9P63128 1117 aa27.93■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 ERVK-24P63145 666 aa27.93■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 SYDE2Q5VT97 1194 aa27.93■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 TTBK2Q6IQ55 1244 aa27.93■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 RBPJLQ9UBG7 517 aa27.93■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 ZBTB43O43298 467 aa27.92■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 GNAQP50148 359 aa27.92■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 PLS1Q14651 629 aa27.92■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 ANKRD1Q15327 319 aa27.92■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 APOA5Q6Q788 366 aa27.92■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 MICU3Q86XE3 530 aa27.92■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 MYL10Q9BUA6 226 aa27.92■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 AGXT2Q9BYV1 514 aa27.92■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 PRR12Q9ULL5 1215 aa27.92■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 SLC16A2P36021 539 aa27.91■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 NEK4P51957 841 aa27.91■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 RCAN1P53805 252 aa27.91■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 APOBRQ0VD83 1088 aa27.91■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 TXNRD2Q9NNW7 524 aa27.91■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 MAD2L2Q9UI95 211 aa27.91■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 KLRF2D3W0D1 207 aa27.9■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.9■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 LZTS2Q9BRK4 669 aa27.9■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa27.9■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 BTBD7Q9P203 1132 aa27.9■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 STAG2Q8N3U4 1231 aa27.89■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 FANCBQ8NB91 859 aa27.89■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 UBA5Q9GZZ9 404 aa27.89■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 SPATC1LQ9H0A9 340 aa27.89■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.89■■■□□ 2.06
RBFA-201ENST00000262197 GOLGA8BA8MQT2 603 aa27.88■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 CNMDO75829 334 aa27.88■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 COPB2P35606 906 aa27.88■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 OAZ1P54368 228 aa27.88■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 FCGRTP55899 365 aa27.88■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 TMEM132BQ14DG7 1078 aa27.88■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 PPP2R5BQ15173 497 aa27.88■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa27.88■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 IL27Q8NEV9 243 aa27.88■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 PNMA2Q9UL42 364 aa27.88■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa27.87■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 GOLGA8AA7E2F4 631 aa27.87■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 RXRAP19793 462 aa27.87■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 STAT3P40763 770 aa27.87■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 RABEP1Q15276 862 aa27.87■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 RTN1Q16799 776 aa27.87■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 CPXCR1Q8N123 301 aa27.87■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 CD99L2Q8TCZ2 262 aa27.87■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 TEX13BQ9BXU2 312 aa27.87■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 SLC25A27O95847 323 aa27.86■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 MAPK4P31152 587 aa27.86■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 Q3C1V9 767 aa27.86■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 POTEEQ6S8J3 1075 aa27.86■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa27.86■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 ADGRF4Q8IZF3 695 aa27.86■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 PRDM10Q9NQV6 1147 aa27.86■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 DOCK3Q8IZD9 2030 aa27.85■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 ATP2A1O14983 1001 aa27.85■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 PEX10O60683 326 aa27.85■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 PSMC4P43686 418 aa27.85■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 EVCP57679 992 aa27.85■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 WDR78Q5VTH9 848 aa27.85■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 CCDC174Q6PII3 467 aa27.85■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 REPS2Q8NFH8 660 aa27.85■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 VAT1LQ9HCJ6 419 aa27.85■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 GNRH1P01148 92 aa27.84■■■□□ 2.05
RBFA-201ENST00000262197 HOXD10P28358 340 aa27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms