RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592052.1

TMEM259-208, Transcript of transmembrane protein 259, human

Gene TMEM259, Length 1,637 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-208	ENST00000592052	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	ALDH1A1	P00352	501 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	BMP3	P12645	472 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	NEK4	P51957	841 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	PDHB	P11177	359 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	BRF1	Q92994	677 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	PNMA3	Q9UL41	463 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	SNHG28	P0DPA3	235 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	OSBP	P22059	807 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	CCDC96	Q2M329	555 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	DDAH1	O94760	285 aa		28.95	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	TROAP	Q12815	778 aa		28.95	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	RABEP1	Q15276	862 aa		28.95	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		28.95	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	APOA5	Q6Q788	366 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	KCTD1	Q719H9	257 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	FLOT1	O75955	427 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	CALM1	P0DP23	149 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	CALM2	P0DP24	149 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	CALM3	P0DP25	149 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	ZNF543	Q08ER8	600 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	APOBR	Q0VD83	1088 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	ANKRD1	Q15327	319 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	MYL10	Q9BUA6	226 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	FEM1B	Q9UK73	627 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	TMEM232	C9JQI7	657 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	COG2	Q14746	738 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	MAP3K14	Q99558	947 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	CYP2C8	P10632	490 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	STAT2	P52630	851 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	IL27	Q8NEV9	243 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	PCNT	O95613	3336 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	ZBTB43	O43298	467 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	MICU3	Q86XE3	530 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	RNF186	Q9NXI6	227 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	CA12	O43570	354 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	PLA2G6	O60733	806 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	AK2	P54819	239 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	GRM4	Q14833	912 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM160B2	Q86V87	743 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	MYPN	Q86TC9	1320 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	TRPA1	O75762	1119 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	KIF5B	P33176	963 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	RCAN1	P53805	252 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	EVC	P57679	992 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	JMY	Q8N9B5	988 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	HERVK_113	P62684	666 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	CRHR2	Q13324	411 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TMEM259-208	ENST00000592052	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	RXRA	P19793	462 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	DSG3	P32926	999 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	FANCB	Q8NB91	859 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TMEM259-208	ENST00000592052	KIFC2	Q96AC6	838 aa		28.87	■■■□□ 2.21

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