RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 HACL1Q9UJ83 578 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 GH2P01242 217 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K10Q02779 954 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF543Q08ER8 600 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 SEPT2Q15019 361 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 PKN1Q16512 942 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 BICD2Q8TD16 824 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 AIFM3Q96NN9 605 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 SIPA1L1O43166 1804 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L5A8MUK1 530 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 GNA11P29992 359 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 GUCY1A2P33402 732 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC1A4P43007 532 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 PRELPP51888 382 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 SLFN13Q68D06 897 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 GMCL1Q96IK5 515 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 GLT8D2Q9H1C3 349 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM196BA6NMK8 535 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 GDF11O95390 407 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 ANO1Q5XXA6 986 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM173BQ6P4H8 233 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB129Q9H1M3 183 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 RIOX1Q9H6W3 641 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 C6orf50Q9HD87 102 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 BARHL2Q9NY43 387 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 RAD21O60216 631 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 CAP2P40123 477 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 ME1P48163 572 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAPPC10P48553 1259 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH4Q9Y623 1939 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 BTBD18B2RXH4 712 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA8HP0CJ92 632 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 USP28Q96RU2 1077 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 PCNTO95613 3336 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 SBF1O95248 1867 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR90Q96KV7 1748 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 TCHHQ07283 1943 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 SPTLC2O15270 562 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 NAPAP54920 295 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 GPT2Q8TD30 523 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 F5H6K3 240 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 BMP3P12645 472 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 KLRC3Q07444 240 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 BLIDQ8IZY5 108 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-212ENST00000591041 ESYT2A0FGR8 921 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF28PB7ZC32 967 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP6R2O75170 966 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 HTRA3P83110 453 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 MCTP2Q6DN12 878 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 TMX2Q9Y320 296 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 SHTN1A0MZ66 631 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM75PA6NK02 468 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 FSTL1Q12841 308 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC39A14Q15043 492 aa25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms