RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPF3Q92784 378 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXP2O15409 715 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC25A27O95847 323 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALX1Q15699 326 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VWA5AO00534 786 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAD21O60216 631 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTLL1O95922 423 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPY3P0CV98 308 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPY8P0CW00 308 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLS1Q14651 629 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPP9Q86TI2 863 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP95Q96GE4 821 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLIN4Q96Q06 1357 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0G2JMZ2 1700 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHA2P01877 340 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADORA2AP29274 412 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TFAP4Q01664 338 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FLRT1Q9NZU1 646 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFB10O96000 172 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COPB2P35606 906 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STAT3P40763 770 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OLFML2BQ68BL8 750 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RIOX2Q8IUF8 465 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RILPL2Q969X0 211 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM227BQ96M60 508 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLF1Q9BQI6 1058 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NR2E3Q9Y5X4 410 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H0YGN5 161 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGRP09769 529 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FCER1AP12319 257 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM47AQ5JRC9 791 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VPS53Q5VIR6 699 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LHX8Q68G74 356 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 REPS2Q8NFH8 660 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBPF3Q9H094 633 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP290O15078 2479 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PARP14Q460N5 1801 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0D9SFI3 127 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COBLO75128 1261 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC34A2O95436 690 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGAP02671 866 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTDSPL2Q05D32 466 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FEM1BQ9UK73 627 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP2A1O14983 1001 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ORC4O43929 436 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MSCO60682 206 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SDSP20132 328 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF236Q9UL36 1845 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZMYM6O95789 1325 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPY2A6NKD2 308 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EVI5O60447 810 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBED4O75132 1171 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP2C19P33261 490 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLFN13Q68D06 897 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEX13BQ9BXU2 312 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C11orf49Q9H6J7 331 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FDX1P10109 184 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BMP3P12645 472 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOVP48745 357 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCTD2Q14681 263 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GMCL1Q96IK5 515 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MMP19Q99542 508 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INCENPQ9NQS7 918 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL17RBQ9NRM6 502 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms