RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 ELP1O95163 1332 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 RAD21O60216 631 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 MBD3O95983 291 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 MYSM1Q5VVJ2 828 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 PHF20Q9BVI0 1012 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 CPVLQ9H3G5 476 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 GPCPD1Q9NPB8 672 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 MYH15Q9Y2K3 1946 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 DCAF4Q8WV16 495 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 HOOK2Q96ED9 719 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 BTBD18B2RXH4 712 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 SLFN13Q68D06 897 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 UBA5Q9GZZ9 404 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 BRMS1Q9HCU9 246 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 SH3GLB2Q9NR46 395 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 UBE2HP62256 183 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 NOSTRINQ8IVI9 506 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 SHISA4Q96DD7 197 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 USP28Q96RU2 1077 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 RIOX1Q9H6W3 641 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 ASNSP08243 561 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 SLC1A4P43007 532 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 DCAF15Q66K64 600 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 VAT1LQ9HCJ6 419 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 PHF20L1A8MW92 1017 aa30.89■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 F5H6K3 240 aa30.89■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 KLRC3Q07444 240 aa30.89■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 GPT2Q8TD30 523 aa30.89■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 KRT2P35908 639 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 NLRP5P59047 1200 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 KCTD1Q719H9 257 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 HOMER1Q86YM7 354 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.539e-6■■□□□ 14.5
HOXB3-210ENST00000489475 GMCL1Q96IK5 515 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 CALML3P27482 149 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 RTEL1Q9NZ71 1219 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 RCOR1Q9UKL0 485 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PRG0 241 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 OXER1Q8TDS5 423 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 PIGSQ96S52 555 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 GINM1Q9NU53 330 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 BARHL2Q9NY43 387 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 TMX2Q9Y320 296 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 NDUFB10O96000 172 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 NR5A1Q13285 461 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 WWC2Q6AWC2 1192 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 TTBK2Q6IQ55 1244 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC148Q8NFR7 591 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 SH2D4AQ9H788 454 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 POLR3EQ9NVU0 708 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF341Q9BYN7 854 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 GOPCQ9HD26 462 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 ADGRF4Q8IZF3 695 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 ACER1Q8TDN7 264 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 ECE1P42892 770 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
HOXB3-210ENST00000489475 STXBP3O00186 592 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 SLC16A2P36021 539 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 NPY5RQ15761 445 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 TPRNQ4KMQ1 711 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 JMJD4Q9H9V9 463 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 CLIC4Q9Y696 253 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 YEATS4O95619 227 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 ANO1Q5XXA6 986 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 GALNT17Q6IS24 598 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 GLTPD2A6NH11 291 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 hCG_1984214I3L0E3 225 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 BMP3P12645 472 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 NASPP49321 788 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 RILPL1Q5EBL4 403 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 NAPAP54920 295 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXB3-210ENST00000489475 STK38Q15208 465 aa30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.6 ms