RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM83BQ5T0W9 1011 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 ANKLE1Q8NAG6 615 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 NPLOC4Q8TAT6 608 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 MROH8Q9H579 483 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 MTMR4Q9NYA4 1195 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 FLRT1Q9NZU1 646 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 F5H6K3 240 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 KLRC3Q07444 240 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM132BQ14DG7 1078 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 OGDHLQ9ULD0 1010 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP1CB-208ENST00000455580 A0A0G2JMZ2 1700 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 VPS53Q5VIR6 699 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 CEP95Q96GE4 821 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 OSBPL3Q9H4L5 887 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 H0YGN5 161 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 VWA5AO00534 786 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 IGHA2P01877 340 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 ADORA2AP29274 412 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 MFSD14CQ5VZR4 134 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 DPP9Q86TI2 863 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 NCAPG2Q86XI2 1143 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM227BQ96M60 508 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC25A27O95847 323 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 TTLL1O95922 423 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 NDUFB10O96000 172 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 TSPY3P0CV98 308 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 TSPY8P0CW00 308 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 TFAP4Q01664 338 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 ALX1Q15699 326 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM47AQ5JRC9 791 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 NECAB2Q7Z6G3 386 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 ABRAQ8N0Z2 381 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.54■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 A0A0D9SFI3 127 aa28.54■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 LHX8Q68G74 356 aa28.54■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 REPS2Q8NFH8 660 aa28.54■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.54■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.54■■■□□ 2.163e-7■□□□□ 9.9
PPP1CB-208ENST00000455580 PARP14Q460N5 1801 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 COBLO75128 1261 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC34A2O95436 690 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 CTDSPL2Q05D32 466 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 RIOX2Q8IUF8 465 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 RILPL2Q969X0 211 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 STAT3P40763 770 aa28.52■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 SLF1Q9BQI6 1058 aa28.52■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 INCENPQ9NQS7 918 aa28.52■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
PPP1CB-208ENST00000455580 OLFML2BQ68BL8 750 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC5A4Q9NY91 659 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 TACC3Q9Y6A5 838 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 FGAP02671 866 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 FCER1AP12319 257 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 CYP2C19P33261 490 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 NBPF3Q9H094 633 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 NR2E3Q9Y5X4 410 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 FGRP09769 529 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 SDSP20132 328 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF236Q9UL36 1845 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 COPB2P35606 906 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 SLFN13Q68D06 897 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 TRPV1Q8NER1 839 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 FEM1BQ9UK73 627 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 TSPY2A6NKD2 308 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 ORC4O43929 436 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 EVI5O60447 810 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 MMP19Q99542 508 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 C11orf49Q9H6J7 331 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 IL17RBQ9NRM6 502 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 MYH4Q9Y623 1939 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 MAML3Q96JK9 1138 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC171Q6TFL3 1326 aa28.45■■■□□ 2.15
PPP1CB-208ENST00000455580 ATP2A1O14983 1001 aa28.45■■■□□ 2.14
PPP1CB-208ENST00000455580 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
PPP1CB-208ENST00000455580 ZBED4O75132 1171 aa28.45■■■□□ 2.14
PPP1CB-208ENST00000455580 BMP3P12645 472 aa28.45■■■□□ 2.14
PPP1CB-208ENST00000455580 CYBAP13498 195 aa28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms