RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 TNFAIP3P21580 790 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ZAP70P43403 619 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA8FQ08AF8 430 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF365Q70YC5 407 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 HAUS8Q9BT25 410 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PEX19P40855 299 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PICALMQ13492 652 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 RPS6KA1Q15418 735 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PROSER3Q2NL68 480 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJC10Q8IXB1 793 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 MGARPQ8TDB4 240 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 LPIN2Q92539 896 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 MCUR1Q96AQ8 359 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 NYXQ9GZU5 481 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ITIH3Q06033 890 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 POLA2Q14181 598 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 LONRF2Q1L5Z9 754 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 RRAGAQ7L523 313 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PFKFB2O60825 505 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 E2F4Q16254 413 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ASIC2Q16515 512 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 RABGGTAQ92696 567 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 TAF5LO75529 589 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 TXKP42681 527 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 KLHL30Q0D2K2 578 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PTPROQ16827 1216 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 DPH6Q7L8W6 267 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 DYMQ7RTS9 669 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 FNBP1Q96RU3 617 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ARMT1Q9H993 441 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 BTG4Q9NY30 223 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 NDUFA8P51970 172 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 HVCN1Q96D96 273 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 MED4Q9NPJ6 270 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 SMTNP53814 917 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 BIRC2Q13490 618 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 RASSF2P50749 326 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 PPP2R5BQ15173 497 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 PEX26Q7Z412 305 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD65E5RJM6 399 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 HSPA2P54652 639 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 RSPH3Q86UC2 560 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ALKQ9UM73 1620 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 I3L4J1 428 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 RASA3Q14644 834 aa9.78□□□□□ -0.84
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