RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397787.5

COL18A1-AS1-201, COL18A1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COL18A1-AS1, Length 3,425 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ATP2B2Q01814 1243 aa15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LRRC31Q6UY01 552 aa15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SHTN1A0MZ66 631 aa15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ERICH2A1L162 156 aa15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 C6orf229H3BNL8 230 aa15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FOXP2O15409 715 aa15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GRIN1Q05586 938 aa15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 POSTNQ15063 836 aa15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 INTS13Q9NVM9 706 aa15.38■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SLC39A14Q15043 492 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MTMR7Q9Y216 660 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MACROD2A1Z1Q3 448 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BTBD18B2RXH4 712 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SERPINB2P05120 415 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MSL1Q68DK7 614 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ANKRD2Q9GZV1 360 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DACH1Q9UI36 760 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NRAPQ86VF7 1730 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 POTEB2H3BUK9 544 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 STIM1Q13586 685 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KCTD16Q68DU8 428 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.37■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ERCC3P19447 782 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FAM76AQ8TAV0 307 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CAPN7Q9Y6W3 813 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MAP2K2P36507 400 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PRDX5P30044 214 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KRT9P35527 623 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 USP49Q70CQ1 688 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CEP57Q86XR8 500 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FAM71BQ8TC56 605 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ADGRG1Q9Y653 693 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.36■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 G3V3G9 751 aa15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ADGRA1Q86SQ6 560 aa15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NEDD4P46934 1319 aa15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FRMD3A2A2Y4 597 aa15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 UFL1O94874 794 aa15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TXNRD1Q16881 649 aa15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GSG1L2A8MUP6 293 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GUCY2CP25092 1073 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 INPP5BP32019 993 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GNGT1P63211 74 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GIMAP7Q8NHV1 300 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KIFC2Q96AC6 838 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SENP2Q9HC62 589 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MYO6Q9UM54 1294 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CTNND2Q9UQB3 1225 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RIMBP2O15034 1052 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PDE6BP35913 854 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ANTXR2P58335 489 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCDC91Q7Z6B0 441 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HSD3B7Q9H2F3 369 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 L1RE1Q9UN81 338 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NDUFAB1O14561 156 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZBTB43O43298 467 aa15.34■□□□□ 0.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GGCXP38435 758 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms