RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 KIFC2Q96AC6 838 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 DIABLOQ9NR28 239 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 GUCY2FP51841 1108 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 POLE2P56282 527 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMD6Q15008 389 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 SH2D4AQ9H788 454 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 RGS12O14924 1447 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP3K10Q02779 954 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 NRBP1Q9UHY1 535 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 DEXIO95424 95 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 IL15P40933 162 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP2R5DQ14738 602 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 ANO1Q5XXA6 986 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 PEX26Q7Z412 305 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 TAF11Q15544 211 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 DESI2Q9BSY9 194 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 PYGBP11216 843 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT9P35527 623 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 HDAC4P56524 1084 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 SLF1Q9BQI6 1058 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 VPS16Q9H269 839 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT15P19012 456 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC12A2P55011 1212 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP8B2P98198 1209 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT39Q6A163 491 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 SRLQ86TD4 932 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 MGARPQ8TDB4 240 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 SHROOM2Q13796 1616 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 TSPY3P0CV98 308 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 TSPY8P0CW00 308 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 GARSP41250 739 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 RAPGEF1Q13905 1077 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 POSTNQ15063 836 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 AMFRQ9UKV5 643 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 CFAP73A6NFT4 308 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR46O15213 610 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 LRGUKQ96M69 825 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 NEK2P51955 445 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 STRN3Q13033 797 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 NSMCE1Q8WV22 266 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-201ENST00000356331 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.65□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 DPH6Q7L8W6 267 aa11.65□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.65□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.65□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 BIRC3Q13489 604 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CASP8Q14790 479 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 SFMBT2Q5VUG0 894 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 MAML3Q96JK9 1138 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ASIC3Q9UHC3 531 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 SEMA3FQ13275 785 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 KCTD16Q68DU8 428 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CUEDC2Q9H467 287 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 GALNT17Q6IS24 598 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 EMBQ6PCB8 327 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 MORC4Q8TE76 937 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 RILPQ96NA2 401 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 C6orf118Q5T5N4 469 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CDKL2Q92772 493 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TNNQ9UQP3 1299 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 F8W8V4 182 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CXorf38Q8TB03 319 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMB7Q99436 277 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 SYNMO15061 1565 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ZPR1O75312 459 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TEX9Q8N6V9 391 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT12Q99456 494 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.3 ms