RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 NT5C2P49902 561 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-202ENST00000334414 ZNF202O95125 648 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-202ENST00000334414 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRB-202ENST00000334414 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRB-202ENST00000334414 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 STXBP3O00186 592 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 HOXB7P09629 217 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 CCT5P48643 541 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 RAP1GDS1P52306 607 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 PDE4DQ08499 809 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 PALM2Q8IXS6 379 aa6.04□□□□□ -1.44
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