RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 BLIDQ8IZY5 108 aa20.51■□□□□ 0.87
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ACTB-201ENST00000331789 AP5Z1O43299 807 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 PDHBP11177 359 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 CALML3P27482 149 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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ACTB-201ENST00000331789 TTLL1O95922 423 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 STX1AQ16623 288 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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ACTB-201ENST00000331789 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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ACTB-201ENST00000331789 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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ACTB-201ENST00000331789 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 PNOCQ13519 176 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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ACTB-201ENST00000331789 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.43■□□□□ 0.86
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