RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 A0A087X0B3 334 aa24.77■■□□□ 1.56
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SPHK1-201ENST00000323374 CBFA2T2O43439 604 aa24.77■■□□□ 1.56
SPHK1-201ENST00000323374 APBA3O96018 575 aa24.77■■□□□ 1.56
SPHK1-201ENST00000323374 MCM7P33993 719 aa24.77■■□□□ 1.56
SPHK1-201ENST00000323374 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SPHK1-201ENST00000323374 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.77■■□□□ 1.56
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SPHK1-201ENST00000323374 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
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SPHK1-201ENST00000323374 CERS5Q8N5B7 392 aa24.74■■□□□ 1.55
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SPHK1-201ENST00000323374 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.73■■□□□ 1.55
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SPHK1-201ENST00000323374 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
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SPHK1-201ENST00000323374 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
SPHK1-201ENST00000323374 TEKT1Q969V4 418 aa24.68■■□□□ 1.54
SPHK1-201ENST00000323374 SWAP70Q9UH65 585 aa24.68■■□□□ 1.54
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF18P17022 549 aa24.67■■□□□ 1.54
SPHK1-201ENST00000323374 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SPHK1-201ENST00000323374 GNA11P29992 359 aa24.67■■□□□ 1.54
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