RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D9BQ66K14 1250 aa31.72■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 TAF1P21675 1872 aa31.72■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 XDHP47989 1333 aa31.72■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 FECHP22830 423 aa31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 NLRP5P59047 1200 aa31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 C3orf67Q6ZVT6 689 aa31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 SMIM5Q71RC9 77 aa31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 SPAG1Q07617 926 aa31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 SBK1Q52WX2 424 aa31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 SLC10A5Q5PT55 438 aa31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 PDXDC2PQ6P474 469 aa31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa31.7■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 NT5C2P49902 561 aa31.7■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 MECOMQ03112 1051 aa31.7■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 MTF1Q14872 753 aa31.7■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 RABGGTAQ92696 567 aa31.7■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 RWDD2AQ9UIY3 292 aa31.7■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 LRRC10BA6NIK2 292 aa31.69■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 KARSQ15046 597 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 RAD9BQ6WBX8 426 aa31.69■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 RASGRP2Q7LDG7 609 aa31.69■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 RMND1Q9NWS8 449 aa31.69■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 CTNND2Q9UQB3 1225 aa31.69■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 GNPATO15228 680 aa31.69■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 CALML3P27482 149 aa31.69■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 KIF5BP33176 963 aa31.69■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa31.69■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA1Q92805 767 aa31.68■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 TUBB2AQ13885 445 aa31.68■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 TUBB2BQ9BVA1 445 aa31.68■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 KIF5CO60282 957 aa31.67■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 LONP1P36776 959 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 PLA2G4AP47712 749 aa31.67■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 BICDL1Q6ZP65 573 aa31.67■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 GYPCP04921 128 aa31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 TRIM14Q14142 442 aa31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 RRAGBQ5VZM2 374 aa31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 NYXQ9GZU5 481 aa31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 SH3GLB2Q9NR46 395 aa31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 CASP14P31944 242 aa31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 PAK1Q13153 545 aa31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 CPLX3Q8WVH0 158 aa31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 NMT2O60551 498 aa31.65■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 KRT31Q15323 416 aa31.65■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 TEX35Q5T0J7 233 aa31.65■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 ZPR1O75312 459 aa31.64■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 MCM7P33993 719 aa31.64■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 TXLNAP40222 546 aa31.64■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 FAM47AQ5JRC9 791 aa31.64■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 TMTC1Q8IUR5 882 aa31.64■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 SEPT12Q8IYM1 358 aa31.64■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB22O15209 634 aa31.64■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 IL17AQ16552 155 aa31.64■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD2Q9GZV1 360 aa31.64■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 BLZF1Q9H2G9 400 aa31.64■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 LZTFL1Q9NQ48 299 aa31.64■■■□□ 2.66
UBP1-201ENST00000283628 TSPY2A6NKD2 308 aa31.63■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 TAF3Q5VWG9 929 aa31.63■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 STAMQ92783 540 aa31.63■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 SETDB2Q96T68 719 aa31.63■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 ST7Q9NRC1 585 aa31.63■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 N4BP3O15049 544 aa31.63■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 MTRQ99707 1265 aa31.63■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP31.62■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 TUBB4BP68371 445 aa31.62■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 AMIGO3Q86WK7 504 aa31.62■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 BLIDQ8IZY5 108 aa31.62■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 RPN1P04843 607 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 COPB1P53618 953 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 RPS8P62241 208 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 RCSD1Q6JBY9 416 aa31.61■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa31.61■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 TCP11X2Q5H9J9 407 aa31.61■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 CEP112Q8N8E3 955 aa31.61■■■□□ 2.65
UBP1-201ENST00000283628 C4orf32Q8N8J7 132 aa31.61■■■□□ 2.65
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