RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261464.9

TRAF5-201, Transcript of TNF receptor associated factor 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF5, Length 3,972 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5-201ENST00000261464 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 RAD17O75943 681 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 PPP2R5BQ15173 497 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 ODF2Q5BJF6 829 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 VPS16Q9H269 839 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 SPA17Q15506 151 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 TXNRD1Q16881 649 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 RMND1Q9NWS8 449 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 DNAI1Q9UI46 699 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 CHMP2AO43633 222 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 NEMFO60524 1076 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 CFBP00751 764 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 SCG2P13521 617 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 USP8P40818 1118 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 NEDD4P46934 1319 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 ARID5AQ03989 594 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 PTGDRQ13258 359 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 CCDC181Q5TID7 509 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 DYMQ7RTS9 669 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 KIF5CO60282 957 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 UTRNP46939 3433 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 COBLO75128 1261 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 SLC16A2P36021 539 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 DDR1Q08345 913 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 POSTNQ15063 836 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 PTPN21Q16825 1174 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 TEX35Q5T0J7 233 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 CEP135Q66GS9 1140 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 BLIDQ8IZY5 108 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 KCNB2Q92953 911 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 FAM196BA6NMK8 535 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 SEMA3EO15041 775 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 TBCAO75347 108 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 PLEKHA8P1O95397 391 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 FANCCQ00597 558 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 PDE4DQ08499 809 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 ERMNQ8TAM6 284 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 CD209Q9NNX6 404 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 LRWD1Q9UFC0 647 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 ATAD5Q96QE3 1844 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 C21orf2O43822 256 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 AKR1B10O60218 316 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 IFNAR1P17181 557 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 UBXN1Q04323 297 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 LRMPQ12912 555 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 RESTQ13127 1097 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 SLC39A14Q15043 492 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 RCOR1Q9UKL0 485 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 FSD2A1L4K1 749 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 CMA1P23946 247 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 CDC27P30260 824 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 CASQ1P31415 396 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 TECP42680 631 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 LIFRP42702 1097 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 ZNF75DP51815 510 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 CCDC174Q6PII3 467 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 NIM1KQ8IY84 436 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 CNKSR1Q969H4 720 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 KIFC2Q96AC6 838 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 PGBD1Q96JS3 809 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF5-201ENST00000261464 WDR90Q96KV7 1748 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 216.8 ms