RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 CSADQ9Y600 493 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 GJB2P29033 226 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 GRM4Q14833 912 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 OTUD5Q96G74 571 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 AIFM3Q96NN9 605 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 CPLX1O14810 134 aa21.62■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC96Q2M329 555 aa21.62■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.62■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 PANK2Q9BZ23 570 aa21.62■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 PKP1Q13835 747 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 MAP3K11Q16584 847 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 CYTH3O43739 400 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 GJA5P36382 358 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 SNAP25P60880 206 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 KLRF2D3W0D1 207 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 SNHG28P0DPA3 235 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 SLC1A4P43007 532 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 HMGCS2P54868 508 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 FUT2Q10981 343 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L10C9JJH3 530 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 IRF6O14896 467 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 CALM1P0DP23 149 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 CALM2P0DP24 149 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 CALM3P0DP25 149 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF543Q08ER8 600 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 OPTNQ96CV9 577 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 VCPKMTQ9H867 229 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 NID2Q14112 1375 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRT1-201ENST00000211413 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.58■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.58■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.58■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 PASKQ96RG2 1323 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM232C9JQI7 657 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 BACE1P56817 501 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 WDR18Q9BV38 432 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 MYH6P13533 1939 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 IFNAR1P17181 557 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 GUCY1B3Q02153 619 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 GOPCQ9HD26 462 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 PCNTO95613 3336 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 BMP3P12645 472 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 KIF5BP33176 963 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 MCTP1Q6DN14 999 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 HOMER1Q86YM7 354 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 PTPRFP10586 1907 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 TOMM70O94826 608 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 RCAN1P53805 252 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 HUNKP57058 714 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 ERO1BQ86YB8 467 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 GINM1Q9NU53 330 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 VCAM1P19320 739 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 DCAF4Q8WV16 495 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 SHISA4Q96DD7 197 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 MAP3K14Q99558 947 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms