RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CSRNP1Q96S65 589 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF28PB7ZC32 967 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SNHG28P0DPA3 235 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 XBP1P17861 261 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 MKL1Q969V6 931 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SYT17Q9BSW7 474 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 NYAP2Q9P242 653 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SHTN1A0MZ66 631 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 GSE1Q14687 1217 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SLURP2P0DP57 97 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K10Q02779 954 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 MICALL2Q8IY33 904 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA32Q96LK8 384 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SBF1O95248 1867 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 VEZTQ9HBM0 779 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM196BA6NMK8 535 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 PDHBP11177 359 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 SCG2P13521 617 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 TNNI2P48788 182 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCB5Q2M3G0 1257 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC35G1Q2M3R5 365 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 SHISA4Q96DD7 197 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 USP28Q96RU2 1077 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 SH3GLB2Q9NR46 395 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 KLRF2D3W0D1 207 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L5A8MUK1 530 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 CYTH3O43739 400 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 NASPP49321 788 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFAIP1Q13829 316 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 GPC2Q8N158 579 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 MYH4Q9Y623 1939 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 YEATS4O95619 227 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 RIOX1Q9H6W3 641 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 BTBD18B2RXH4 712 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 H7C1D1 291 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 EGFRP00533 1210 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 SEPT2Q15019 361 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 CABP5Q9NP86 173 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-207ENST00000589146 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF543Q08ER8 600 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT2P35908 639 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 JAG1P78504 1218 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ICA1Q05084 483 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 RASA3Q14644 834 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 NPY5RQ15761 445 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ANO1Q5XXA6 986 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 DCAF4Q8WV16 495 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 PGBD1Q96JS3 809 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 TEPSINQ96N21 525 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 GDF11O95390 407 aa26.24■■□□□ 1.79
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