RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	MKL1	Q969V6	931 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L5	A8MUK1	530 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	PFKFB2	O60825	505 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	LARGE1	O95461	756 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	STK3	Q13188	491 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	MICU3	Q86XE3	530 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	FKBP1B	P68106	108 aa		33.32	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		33.32	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	SH2D4A	Q9H788	454 aa		33.32	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	33.31	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		33.31	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		33.31	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	MYL10	Q9BUA6	226 aa		33.31	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	WBP1L	Q9NX94	342 aa		33.31	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	33.3	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	NECAB1	Q8N987	351 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	GTF3C6	Q969F1	213 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	TROAP	Q12815	778 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	VGLL4	Q14135	290 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	PPP2R5B	Q15173	497 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	MAP3K14	Q99558	947 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	NID2	Q14112	1375 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	UNCX	A6NJT0	531 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	PTPRA	P18433	802 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	LBX1	P52954	281 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	CUL4A	Q13619	759 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	RTN1	Q16799	776 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	MOB2	Q70IA6	237 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	FANCB	Q8NB91	859 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	TMX2	Q9Y320	296 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	RXRA	P19793	462 aa		33.26	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	KIF5B	P33176	963 aa		33.26	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	SCRN1	Q12765	414 aa		33.26	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	WDR18	Q9BV38	432 aa		33.26	■■■□□ 2.92
TTC19-208	ENST00000497842	RASSF10	A6NK89	507 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	ACER1	Q8TDN7	264 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	FEZ1	Q99689	392 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	GOPC	Q9HD26	462 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	MTMR7	Q9Y216	660 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842		A0A1W2PRG0	241 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	ECE1	P42892	770 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	GRM4	Q14833	912 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	CPLX1	O14810	134 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	SLC4A3	P48751	1232 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	ELP3	Q9H9T3	547 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842		F5H6K3	240 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	RAD21	O60216	631 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	KLRC3	Q07444	240 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	SLFN13	Q68D06	897 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	ERO1B	Q86YB8	467 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	DCAF4	Q8WV16	495 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L10	C9JJH3	530 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	PDHB	P11177	359 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	GNAQ	P50148	359 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	ST3GAL1	Q11201	340 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	CST9	Q5W186	159 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
TTC19-208	ENST00000497842	CDKL5	O76039	1030 aa		33.2	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	SNHG28	P0DPA3	235 aa		33.2	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	CDC27	P30260	824 aa		33.2	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms