RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 MYCP01106 439 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 SDSP20132 328 aa28.55■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 ERVK-9P63128 1117 aa28.55■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 ERVK-24P63145 666 aa28.55■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 PDE4BQ07343 736 aa28.55■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.55■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.55■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.55■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 PDE4AP27815 886 aa28.54■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.54■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
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SMKR1-201ENST00000462322 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa28.54■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 DOCK3Q8IZD9 2030 aa28.53■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 Q3C1V9 767 aa28.53■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 POTEFA5A3E0 1075 aa28.52■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 ADCY3O60266 1144 aa28.52■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 IRF5Q13568 498 aa28.52■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 COG2Q14746 738 aa28.52■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 ALX1Q15699 326 aa28.52■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 SLAIN1Q8ND83 568 aa28.52■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 GOPCQ9HD26 462 aa28.52■■■□□ 2.16
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC171Q6TFL3 1326 aa28.51■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 RAD21O60216 631 aa28.51■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 MAPK4P31152 587 aa28.51■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 LBX2Q6XYB7 198 aa28.51■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa28.51■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 HOXC10Q9NYD6 342 aa28.51■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
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SMKR1-201ENST00000462322 CNMDO75829 334 aa28.5■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 CTDSPL2Q05D32 466 aa28.5■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 PORCNQ9H237 461 aa28.5■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 NYAP2Q9P242 653 aa28.5■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 HIP1O00291 1037 aa28.49■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 TSPY3P0CV98 308 aa28.49■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 TSPY8P0CW00 308 aa28.49■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
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SMKR1-201ENST00000462322 CCNA1P78396 465 aa28.49■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 PXYLP1Q8TE99 480 aa28.49■■■□□ 2.15
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SMKR1-201ENST00000462322 GJD2Q9UKL4 321 aa28.49■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa28.48■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 FLOT1O75955 427 aa28.48■■■□□ 2.15
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SMKR1-201ENST00000462322 UBXN2AP68543 259 aa28.48■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 FAM47AQ5JRC9 791 aa28.48■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 BTBD7Q9P203 1132 aa28.48■■■□□ 2.15
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SMKR1-201ENST00000462322 TFAP4Q01664 338 aa28.47■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 MTFR1Q15390 333 aa28.47■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 TTC22Q5TAA0 569 aa28.47■■■□□ 2.15
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SMKR1-201ENST00000462322 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.47■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
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SMKR1-201ENST00000462322 GPR142Q7Z601 462 aa28.46■■■□□ 2.15
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SMKR1-201ENST00000462322 NUDT12Q9BQG2 462 aa28.46■■■□□ 2.15
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SMKR1-201ENST00000462322 MTMR4Q9NYA4 1195 aa28.46■■■□□ 2.15
SMKR1-201ENST00000462322 EN2P19622 333 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
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SMKR1-201ENST00000462322 SOCS4Q8WXH5 440 aa28.45■■■□□ 2.14
SMKR1-201ENST00000462322 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.45■■■□□ 2.14
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SMKR1-201ENST00000462322 TSPY2A6NKD2 308 aa28.43■■■□□ 2.14
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SMKR1-201ENST00000462322 CYP2B6P20813 491 aa28.43■■■□□ 2.14
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SMKR1-201ENST00000462322 RNF208Q9H0X6 261 aa28.43■■■□□ 2.14
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SMKR1-201ENST00000462322 TACC3Q9Y6A5 838 aa28.42■■■□□ 2.14
SMKR1-201ENST00000462322 ORC4O43929 436 aa28.41■■■□□ 2.14
SMKR1-201ENST00000462322 HAND2P61296 217 aa28.41■■■□□ 2.14
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SMKR1-201ENST00000462322 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
SMKR1-201ENST00000462322 SPATC1LQ9H0A9 340 aa28.41■■■□□ 2.14
SMKR1-201ENST00000462322 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa28.41■■■□□ 2.14
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