RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KANSL2Q9H9L4 492 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOXP2O15409 715 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNMDO75829 334 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBXN2AP68543 259 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATP2B2Q01814 1243 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LPAR1Q92633 364 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAPBQ9H115 298 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PORCNQ9H237 461 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VCPKMTQ9H867 229 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GJD2Q9UKL4 321 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLXNB2O15031 1838 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCL5P13501 91 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAPK4P31152 587 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LBX2Q6XYB7 198 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPICE1Q8N0Z3 855 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM227BQ96M60 508 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HELLSQ9NRZ9 838 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A0D9SFI3 127 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRDM1O75626 825 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 INHAP05111 366 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPARAQ07869 468 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COG2Q14746 738 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VPS53Q5VIR6 699 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RILPL2Q969X0 211 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF287Q9HBT7 754 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BTBD7Q9P203 1132 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RLFQ13129 1914 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR142Q7Z601 462 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TICAM2Q86XR7 235 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF208Q9H0X6 261 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UNC93B1Q9H1C4 597 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A0G2JMZ2 1700 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCNA1P78396 465 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDE4BQ07343 736 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUDT12Q9BQG2 462 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GOPCQ9HD26 462 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HOXC10Q9NYD6 342 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAD21O60216 631 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FLOT1O75955 427 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GJB1P08034 283 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP2B6P20813 491 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DSG3P32926 999 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SHISA4Q96DD7 197 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NYAP2Q9P242 653 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PARP14Q460N5 1801 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HMGCRP04035 888 aa18.52■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MORN1Q5T089 497 aa18.52■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR78Q5VTH9 848 aa18.52■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP6NLQ92738 828 aa18.52■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATG4CQ96DT6 458 aa18.52■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CEP95Q96GE4 821 aa18.52■□□□□ 0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.52■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TSPY3P0CV98 308 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TSPY8P0CW00 308 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SDSP20132 328 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDE4AP27815 886 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GJA8P48165 433 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM32Q13049 653 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALX1Q15699 326 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM83BQ5T0W9 1011 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MB21D1Q8N884 522 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NKX2-3Q8TAU0 364 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIB2Q92519 343 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa18.51■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC171Q6TFL3 1326 aa18.5■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 F5H6K3 240 aa18.5■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RGS2P41220 211 aa18.5■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLRC3Q07444 240 aa18.5■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NEDD1Q8NHV4 660 aa18.5■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPATC1LQ9H0A9 340 aa18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms