RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 HDXQ7Z353 690 aa4.96□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 F13A1P00488 732 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 NTF4P34130 210 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 TTC6Q86TZ1 520 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 GOLM1Q8NBJ4 401 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 MYLIPQ8WY64 445 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 SEMA3GQ9NS98 782 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 GFRA2O00451 464 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 GARTP22102 1010 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 SNAP47Q5SQN1 464 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 FBXL19Q6PCT2 694 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 HSPA12BQ96MM6 686 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 KCNK12Q9HB15 430 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 FAM221AA4D161 298 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 FANCGO15287 622 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF394Q53GI3 561 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 IRF2BP1Q8IU81 584 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 GATAD2BQ8WXI9 593 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 PEX10O60683 326 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 CILPO75339 1184 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 DLG4P78352 724 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 NFKB2Q00653 900 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 NAALADL2Q58DX5 795 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 USP48Q86UV5 1035 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 KCT2Q8NC54 265 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 FBXO27Q8NI29 283 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 FBRSQ9HAH7 460 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 SLAMF8Q9P0V8 285 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 TLR3O15455 904 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 BPNT1O95861 308 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 GRK4P32298 578 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 SPATS1Q496A3 300 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF654Q8IZM8 581 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 MFSD4AQ8N468 514 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 SLC6A17Q9H1V8 727 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 CCSER2Q9H7U1 834 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 NKG7Q16617 165 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 SLC43A3Q8NBI5 491 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF507Q8TCN5 953 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 CORINQ9Y5Q5 1042 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 GRIN3BO60391 1043 aa4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 GREM1O60565 184 aa4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 HPXP02790 462 aa4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP10-2P60368 255 aa4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 RACK1P63244 317 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 CDKAL1Q5VV42 579 aa4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM132EQ6IEE7 984 aa4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 TINF2Q9BSI4 451 aa4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 KCNQ5Q9NR82 932 aa4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 UBP1Q9NZI7 540 aa4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 KCTD3Q9Y597 815 aa4.91□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 H3BS24 57 aa4.9□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 IGSF3O75054 1194 aa4.9□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 EOMESO95936 686 aa4.9□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 PGRP06401 933 aa4.9□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 CRKP46108 304 aa4.9□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 MPP2Q14168 576 aa4.9□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.9□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 REC114Q7Z4M0 266 aa4.9□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 SPON2Q9BUD6 331 aa4.9□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 ACBD3Q9H3P7 528 aa4.9□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.9□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM13O60858 407 aa4.9□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 HID1Q8IV36 788 aa4.9□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 LILRA2Q8N149 483 aa4.9□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 MCOLN1Q9GZU1 580 aa4.9□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 PLCG1P19174 1290 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 PDE4BQ07343 736 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 SEZ6Q53EL9 994 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms