RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 HAUS7Q99871 368 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 ASPNQ9BXN1 380 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 EPN3Q9H201 632 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 FAM86C1Q9NVL1 165 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 HMX2A2RU54 273 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 SHOXO15266 292 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 CBFA2T2O43439 604 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 LEFTY1O75610 366 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 EPHX1P07099 455 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 FAM87AP0C7U9 286 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 CANXP27824 592 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 DCAF15Q66K64 600 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 LILRB2Q8N423 598 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 JMYQ8N9B5 988 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 GIMAP7Q8NHV1 300 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 TP53INP1Q96A56 240 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 FBXL18Q96ME1 805 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 KLHL25Q9H0H3 589 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 C7orf69Q9H7B7 122 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ZMYM5Q9UJ78 669 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 RAXQ9Y2V3 346 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD34BA5PLL1 514 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ENPP3O14638 875 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ITGB2P05107 769 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 NAT2P11245 290 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 CYP7A1P22680 504 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ADMP35318 185 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 C2orf27AQ580R0 203 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 GPAT2Q6NUI2 795 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 PRR23CQ6ZRP0 262 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ZAR1Q86SH2 424 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 C7orf61Q8IZ16 206 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 COX4I2Q96KJ9 171 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D32Q96NH3 1257 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 STOML1Q9UBI4 398 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 NBPF9Q3BBW0 867 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 OGFOD3Q6PK18 319 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 GBP3Q9H0R5 595 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 APEX2Q9UBZ4 518 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 KDM2BQ8NHM5 1336 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 IQCA1LA6NCM1 817 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ADCY3O60266 1144 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 CD247P20963 164 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 HSD3B2P26439 372 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 SQSTM1Q13501 440 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 TCEAL1Q15170 157 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 SV2CQ496J9 727 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 RNF43Q68DV7 783 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 SHISA5Q8N114 240 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 SGSM3Q96HU1 749 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 Q96M66 194 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 FGD4Q96M96 766 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 MFSD14AQ96MC6 490 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 APBA2Q99767 749 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 SPATA9Q9BWV2 254 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 GP6Q9HCN6 339 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM260Q9NX78 707 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 WHRNQ9P202 907 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ESYT3A0FGR9 886 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 FAM170BA6NMN3 283 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 AGRPO00253 132 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 LRRN2O75325 713 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 F13BP05160 661 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ITGA4P13612 1032 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 KIR3DL1P43629 444 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 CYP27A1Q02318 531 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 CYP27C1Q4G0S4 372 aa4.61□□□□□ -1.67
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