RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 SLURP2P0DP57 97 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 GNAQP50148 359 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 CCDC93Q567U6 631 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 JMYQ8N9B5 988 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 CTAGE5O15320 804 aa20.58■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 PFKFB1P16118 471 aa20.58■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 NOVP48745 357 aa20.58■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 SHC4Q6S5L8 630 aa20.58■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.58■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS3O15072 1205 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 CYTH3O43739 400 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 SHMT1P34896 483 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 TCP10Q12799 353 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
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ACTB-201ENST00000331789 SWAP70Q9UH65 585 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 PSME4Q14997 1843 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB7AO95365 584 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 HLA-DOAP06340 250 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 NLRP5P59047 1200 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 SIPA1L1O43166 1804 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 KLRF2D3W0D1 207 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 CUTAO60888 179 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 ZNF202O95125 648 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 CPVLQ9H3G5 476 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 PSMD1Q99460 953 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 IDI2Q9BXS1 227 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 USP17L5A8MUK1 530 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 CFAP100Q494V2 611 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 RESP18Q5W5W9 173 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 SDF4Q9BRK5 362 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 COL4A5P29400 1685 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 GRIN1Q05586 938 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 USP25Q9UHP3 1055 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 HPSEQ9Y251 543 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 WNT7AO00755 349 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 RAD17O75943 681 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 EHD4Q9H223 541 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC18Q9H819 358 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 A0A087WWV3 80 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 TRIM75PA6NK02 468 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 FAM196BA6NMK8 535 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 SYKP43405 635 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 SPECC1Q5M775 1068 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 CBX8Q9HC52 389 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 PTPREP23469 700 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 LUZP1Q86V48 1076 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-201ENST00000331789 MYH4Q9Y623 1939 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 PSMD14O00487 310 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 ZNF174Q15697 407 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-201ENST00000331789 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.51■□□□□ 0.87
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